190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3419 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3419  Glycerone kinase  100 
 
 		 362 aa  742    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0658381  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3286  dihydroxyacetone kinase family protein  99.7 
 
 		 333 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0949  dihydroxyacetone kinase family protein  100 
 
 		 362 aa  742    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.181047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  66.27 
 
 		 334 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  63.66 
 
 		 333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22060  Glycerone kinase  64.26 
 
 		 333 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  65.17 
 
 		 333 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  63.66 
 
 		 334 aa  428  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1340  Glycerone kinase  64.76 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579574  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0356  Glycerone kinase  67.67 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  64.86 
 
 		 588 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  60.24 
 
 		 331 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  62.61 
 
 		 612 aa  398  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  63.25 
 
 		 589 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  58.26 
 
 		 598 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1572  dihydroxyacetone kinase family protein  62.11 
 
 		 330 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0152467  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3823  Glycerone kinase  63.04 
 
 		 330 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4069  Glycerone kinase  62.73 
 
 		 330 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1809  dihydroxyacetone kinase family protein  62.73 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.331719  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0807  dihydroxyacetone kinase family protein  62.73 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1098  dihydroxyacetone kinase family protein  62.73 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210139  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0460  dihydroxyacetone kinase  62.73 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.418275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0365  dihydroxyacetone kinase, subunit I  62.73 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2071  dihydroxyacetone kinase family protein  62.73 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1796  putative kinase  62.42 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3211  Glycerone kinase  52.27 
 
 		 332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  45.62 
 
 		 335 aa  311  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  50 
 
 		 333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.18 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.74 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  45.68 
 
 		 334 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  46.18 
 
 		 331 aa  285  9e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  44.44 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  44.92 
 
 		 332 aa  282  6.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  41.41 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.3 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.5 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  43.43 
 
 		 694 aa  275  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  43.43 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  43.43 
 
 		 695 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.02 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  43.73 
 
 		 700 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  43.12 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.88 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  43.97 
 
 		 569 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.4 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.95 
 
 		 332 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.64 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.95 
 
 		 333 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  42.64 
 
 		 587 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.34 
 
 		 332 aa  259  7e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.63 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  40.3 
 
 		 333 aa  255  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.92 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.12 
 
 		 333 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.14 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.64 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  41.28 
 
 		 694 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3953  dihydroxyacetone kinase  42.64 
 
 		 587 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  39.23 
 
 		 616 aa  252  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.83 
 
 		 364 aa  252  8.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3761  Dak kinase  42.63 
 
 		 327 aa  252  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.33 
 
 		 333 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1547  dihydroxyacetone kinase  41.44 
 
 		 585 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.462978  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.68 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.69 
 
 		 331 aa  248  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  40.99 
 
 		 582 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  39.88 
 
 		 619 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.86 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.34 
 
 		 330 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.82 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  42.24 
 
 		 583 aa  246  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.24 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.24 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  41.93 
 
 		 583 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.64 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  41.93 
 
 		 583 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.73 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.73 
 
 		 333 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  41.1 
 
 		 583 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.25 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.23 
 
 		 331 aa  242  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.68 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.03 
 
 		 369 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.03 
 
 		 356 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  38.69 
 
 		 581 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.75 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  37.75 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.75 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.68 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.75 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  37.75 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  39.16 
 
 		 569 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.75 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  39.76 
 
 		 581 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.81 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.6 
 
 		 327 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.83 
 
 		 354 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  42.24 
 
 		 583 aa  235  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  39.45 
 
 		 581 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>