190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1340 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1340  Glycerone kinase  100 
 
 		 334 aa  670    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  64.46 
 
 		 334 aa  463  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  65.36 
 
 		 333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  63.25 
 
 		 334 aa  447  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  66.77 
 
 		 333 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  68.28 
 
 		 589 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22060  Glycerone kinase  65.86 
 
 		 333 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  68.88 
 
 		 588 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  67.66 
 
 		 612 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3286  dihydroxyacetone kinase family protein  64.46 
 
 		 333 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  65.76 
 
 		 598 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0949  dihydroxyacetone kinase family protein  64.76 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.181047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3419  Glycerone kinase  64.76 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0658381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  63.55 
 
 		 331 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0356  Glycerone kinase  64.65 
 
 		 330 aa  394  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1572  dihydroxyacetone kinase family protein  63.83 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0152467  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1809  dihydroxyacetone kinase family protein  67.77 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.331719  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1796  putative kinase  67.77 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0807  dihydroxyacetone kinase family protein  67.77 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1098  dihydroxyacetone kinase family protein  67.77 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210139  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0460  dihydroxyacetone kinase  68.07 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.418275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0365  dihydroxyacetone kinase, subunit I  68.07 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2071  dihydroxyacetone kinase family protein  67.77 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4069  Glycerone kinase  65 
 
 		 330 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3211  Glycerone kinase  54.71 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3823  Glycerone kinase  63.22 
 
 		 330 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  43.75 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  49.03 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  46.48 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  45.62 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.85 
 
 		 332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  43.87 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  48.2 
 
 		 569 aa  278  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.5 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.07 
 
 		 332 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  44.41 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.99 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.11 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  42.73 
 
 		 694 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  46.48 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  44.92 
 
 		 332 aa  269  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  42.94 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.3 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  41.52 
 
 		 695 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  42.12 
 
 		 700 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.07 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.96 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.27 
 
 		 333 aa  258  8e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  41.99 
 
 		 587 aa  257  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  41.82 
 
 		 694 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3761  Dak kinase  44.38 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.34 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.86 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.03 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.16 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.12 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.36 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.77 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.55 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  40.48 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.16 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  39.2 
 
 		 573 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3953  dihydroxyacetone kinase  41.39 
 
 		 587 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.82 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.12 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  40.77 
 
 		 569 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.61 
 
 		 331 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.38 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.72 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.21 
 
 		 330 aa  238  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.34 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.91 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1154  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.14 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543562  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  35.44 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  40.67 
 
 		 581 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.94 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.89 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.83 
 
 		 354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.69 
 
 		 355 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  40.92 
 
 		 581 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.62 
 
 		 331 aa  228  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.55 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  38.75 
 
 		 583 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  40.62 
 
 		 581 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  36.56 
 
 		 582 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  40.62 
 
 		 581 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  39.94 
 
 		 619 aa  225  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.86 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.39 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.54 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  37.12 
 
 		 583 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  37.12 
 
 		 583 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  37.12 
 
 		 583 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.42 
 
 		 320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  37.96 
 
 		 616 aa  221  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.83 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2347  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.03 
 
 		 333 aa  219  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.47 
 
 		 329 aa  219  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.47 
 
 		 329 aa  219  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  41.95 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.817448 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>