190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3823 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3823  Glycerone kinase  100 
 
 		 330 aa  667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  86.36 
 
 		 331 aa  577  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1572  dihydroxyacetone kinase family protein  88.79 
 
 		 330 aa  575  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0152467  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4069  Glycerone kinase  88.48 
 
 		 330 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  68.31 
 
 		 333 aa  463  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  64.74 
 
 		 334 aa  438  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  65.81 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3419  Glycerone kinase  63.04 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0658381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0949  dihydroxyacetone kinase family protein  63.04 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.181047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3286  dihydroxyacetone kinase family protein  62.73 
 
 		 333 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1340  Glycerone kinase  63.22 
 
 		 334 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  60 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22060  Glycerone kinase  59.38 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  63.33 
 
 		 588 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  64.49 
 
 		 589 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0356  Glycerone kinase  60.79 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  61.25 
 
 		 612 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3211  Glycerone kinase  55.45 
 
 		 332 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  58.54 
 
 		 598 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0460  dihydroxyacetone kinase  64.69 
 
 		 334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.418275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0365  dihydroxyacetone kinase, subunit I  64.69 
 
 		 334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1809  dihydroxyacetone kinase family protein  64.38 
 
 		 334 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.331719  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0807  dihydroxyacetone kinase family protein  64.38 
 
 		 334 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1098  dihydroxyacetone kinase family protein  64.38 
 
 		 334 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210139  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2071  dihydroxyacetone kinase family protein  64.38 
 
 		 334 aa  351  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1796  putative kinase  64.38 
 
 		 334 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.95 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  43.61 
 
 		 335 aa  287  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  49.07 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  47.2 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.42 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  47.66 
 
 		 700 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  47.42 
 
 		 333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  45.4 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  43.03 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.81 
 
 		 332 aa  279  4e-74  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  44.86 
 
 		 695 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  46.89 
 
 		 569 aa  278  7e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  43.56 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.35 
 
 		 332 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  42.99 
 
 		 694 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  43.29 
 
 		 583 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  43.29 
 
 		 583 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  43.29 
 
 		 583 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3761  Dak kinase  45.03 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.46 
 
 		 329 aa  265  8e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.5 
 
 		 332 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  43.93 
 
 		 694 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  42.5 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.55 
 
 		 331 aa  261  8e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  41.18 
 
 		 582 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  43.6 
 
 		 332 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  43.29 
 
 		 583 aa  259  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  43.6 
 
 		 583 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  42.11 
 
 		 583 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  43.29 
 
 		 583 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  42.99 
 
 		 583 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  42.99 
 
 		 583 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.59 
 
 		 333 aa  256  5e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  42.99 
 
 		 583 aa  255  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  42.68 
 
 		 583 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.73 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.73 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.73 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.51 
 
 		 330 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.43 
 
 		 332 aa  248  8e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  40.06 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.64 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.16 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.55 
 
 		 333 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.81 
 
 		 330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.34 
 
 		 333 aa  245  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.43 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.55 
 
 		 333 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.16 
 
 		 333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.51 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.88 
 
 		 355 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.44 
 
 		 333 aa  238  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.73 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.77 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.82 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.75 
 
 		 331 aa  236  6e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.25 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.63 
 
 		 331 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.17 
 
 		 364 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.84 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  40.48 
 
 		 569 aa  232  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.03 
 
 		 333 aa  232  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0620  Glycerone kinase  46.2 
 
 		 336 aa  231  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.9 
 
 		 331 aa  231  9e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  40 
 
 		 587 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  40.43 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.07 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  39.81 
 
 		 573 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.55 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.3 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.99 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1154  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.24 
 
 		 335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.41 
 
 		 356 aa  225  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.41 
 
 		 369 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>