190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1359 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  99.44 
 
 		 356 aa  729    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.260612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  99.44 
 
 		 356 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  99.44 
 
 		 356 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  100 
 
 		 369 aa  762    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  99.44 
 
 		 356 aa  729    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  98.88 
 
 		 356 aa  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  99.16 
 
 		 356 aa  728    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  99.16 
 
 		 356 aa  730    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  76.06 
 
 		 356 aa  582  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  60.73 
 
 		 352 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.56 
 
 		 354 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.8 
 
 		 354 aa  449  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60 
 
 		 354 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  59.44 
 
 		 354 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  56.47 
 
 		 364 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  55.21 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.78 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.81 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.66 
 
 		 332 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.7 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 		 333 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.81 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.09 
 
 		 333 aa  355  6.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.81 
 
 		 333 aa  349  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.86 
 
 		 331 aa  349  5e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.09 
 
 		 333 aa  348  9e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.25 
 
 		 333 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.01 
 
 		 327 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.63 
 
 		 331 aa  336  3.9999999999999995e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.11 
 
 		 331 aa  331  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.47 
 
 		 330 aa  329  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.6 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.88 
 
 		 329 aa  326  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.91 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.32 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.32 
 
 		 329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2347  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.53 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.91 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  48.88 
 
 		 330 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  46.59 
 
 		 332 aa  318  7.999999999999999e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.61 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.28 
 
 		 332 aa  316  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.89 
 
 		 331 aa  315  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.61 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  45.63 
 
 		 327 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.3 
 
 		 332 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1154  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.42 
 
 		 335 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543562  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  46.8 
 
 		 329 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.16 
 
 		 329 aa  302  8.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.21 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.48 
 
 		 332 aa  293  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.38 
 
 		 333 aa  292  8e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.84 
 
 		 331 aa  291  9e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2457  Glycerone kinase  46.2 
 
 		 332 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  41.48 
 
 		 582 aa  286  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.76 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.37 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.48 
 
 		 332 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.42 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  40.79 
 
 		 583 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  40.79 
 
 		 583 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  40.51 
 
 		 583 aa  271  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  40.79 
 
 		 583 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  40.79 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  40.51 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.82 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  40.79 
 
 		 583 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  40.51 
 
 		 583 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  40.51 
 
 		 583 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  40.51 
 
 		 583 aa  264  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  40.92 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  43.77 
 
 		 567 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  39.66 
 
 		 583 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  40.92 
 
 		 334 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  44.84 
 
 		 567 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  42.61 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  41.67 
 
 		 544 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.33 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  42.22 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  38.59 
 
 		 694 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  38.83 
 
 		 695 aa  252  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  41.05 
 
 		 572 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.33 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.33 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  40.5 
 
 		 567 aa  245  8e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  39.11 
 
 		 700 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  39.32 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  39.56 
 
 		 569 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  39.56 
 
 		 569 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  39.56 
 
 		 566 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  38 
 
 		 333 aa  243  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  38.21 
 
 		 546 aa  242  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  37.25 
 
 		 333 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  38.14 
 
 		 694 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.71 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.46 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  40.77 
 
 		 616 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  39.94 
 
 		 566 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  38.29 
 
 		 544 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  41.12 
 
 		 572 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>