291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4101 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  100 
 
 
544 aa  1083    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  64.13 
 
 
544 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  63.75 
 
 
544 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  63.75 
 
 
544 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  56.96 
 
 
546 aa  584  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  35.12 
 
 
582 aa  317  3e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  41.77 
 
 
572 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  41.59 
 
 
560 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  35.11 
 
 
583 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  35.11 
 
 
583 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  42.19 
 
 
567 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  34.83 
 
 
583 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  34.38 
 
 
583 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50 
 
 
332 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  40.43 
 
 
567 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  34.48 
 
 
583 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2457  Glycerone kinase  50.61 
 
 
332 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  34.48 
 
 
583 aa  294  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  34.31 
 
 
583 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  34.31 
 
 
583 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  34.83 
 
 
583 aa  292  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  34.31 
 
 
583 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  34.48 
 
 
583 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.26 
 
 
330 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.46 
 
 
330 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  39.5 
 
 
567 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.38 
 
 
333 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  38.64 
 
 
566 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.23 
 
 
332 aa  279  7e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  38.52 
 
 
569 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  38.52 
 
 
569 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44 
 
 
333 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  38.83 
 
 
572 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.26 
 
 
355 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.85 
 
 
333 aa  274  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.88 
 
 
354 aa  274  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  39.68 
 
 
616 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  37.92 
 
 
566 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.14 
 
 
356 aa  270  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.57 
 
 
331 aa  270  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  46.85 
 
 
330 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.43 
 
 
369 aa  269  8e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.14 
 
 
356 aa  269  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.43 
 
 
356 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  43.43 
 
 
356 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.43 
 
 
356 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  43.43 
 
 
356 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.43 
 
 
356 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.34 
 
 
331 aa  266  7e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.11 
 
 
364 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.86 
 
 
332 aa  264  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.04 
 
 
354 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.46 
 
 
354 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.6 
 
 
333 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.15 
 
 
333 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.69 
 
 
333 aa  262  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2347  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.77 
 
 
333 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.34 
 
 
333 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.04 
 
 
333 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44 
 
 
327 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.06 
 
 
354 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.69 
 
 
329 aa  261  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.69 
 
 
329 aa  261  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  39.47 
 
 
570 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  39.47 
 
 
570 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  34.27 
 
 
577 aa  259  7e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  39.47 
 
 
570 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  39.47 
 
 
616 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.17 
 
 
329 aa  256  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.56 
 
 
333 aa  256  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  43.56 
 
 
332 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  44.62 
 
 
329 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.02 
 
 
330 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.36 
 
 
332 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.24 
 
 
329 aa  254  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  42.37 
 
 
327 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  32.25 
 
 
598 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.44 
 
 
332 aa  249  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  40 
 
 
352 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.8 
 
 
356 aa  247  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01180  dihydroxyacetone kinase  47.56 
 
 
332 aa  244  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.69 
 
 
332 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.21 
 
 
331 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.8 
 
 
331 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.81 
 
 
332 aa  242  2e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.12 
 
 
329 aa  240  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04180  dihydroxyacetone kinase 1, putative  32.93 
 
 
591 aa  239  6.999999999999999e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.12537  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  34.14 
 
 
580 aa  239  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4584  Glycerone kinase  33.57 
 
 
539 aa  236  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150824  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.34 
 
 
331 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00034  dihydroxyacetone kinase (Eurofung)  32.66 
 
 
590 aa  231  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.160552 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57462  dihydroxyacetone kinase  30.65 
 
 
595 aa  230  4e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0972297  normal  0.404993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.62 
 
 
331 aa  229  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  33.04 
 
 
581 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  33.04 
 
 
581 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  31.64 
 
 
612 aa  229  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2432  Glycerone kinase  35.47 
 
 
547 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739383  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  34.26 
 
 
581 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.81 
 
 
332 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2726  Glycerone kinase  35.69 
 
 
556 aa  226  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>