293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2432 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2167  Glycerone kinase  88.02 
 
 
544 aa  868    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2432  Glycerone kinase  100 
 
 
547 aa  1075    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739383  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2889  Glycerone kinase  55.93 
 
 
542 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4584  Glycerone kinase  50.09 
 
 
539 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150824  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  51.5 
 
 
548 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2726  Glycerone kinase  53.79 
 
 
556 aa  479  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0963  Glycerone kinase  55.27 
 
 
545 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459045  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0893  Glycerone kinase  53.51 
 
 
546 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3559  Glycerone kinase  55.45 
 
 
549 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.463491  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1031  Glycerone kinase  55.68 
 
 
545 aa  452  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593318  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1158  Glycerone kinase  55.31 
 
 
545 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263533  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2326  Glycerone kinase  45.08 
 
 
562 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  41.54 
 
 
580 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  42.93 
 
 
567 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  43.11 
 
 
567 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  37.26 
 
 
577 aa  314  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  43.16 
 
 
567 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57462  dihydroxyacetone kinase  37.01 
 
 
595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0972297  normal  0.404993 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  42.08 
 
 
566 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  43.41 
 
 
566 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  41.91 
 
 
572 aa  290  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  43.08 
 
 
569 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  43.08 
 
 
569 aa  289  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  43.23 
 
 
616 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  42.98 
 
 
570 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  42.66 
 
 
616 aa  282  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  42.81 
 
 
570 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  42.83 
 
 
570 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  35.68 
 
 
583 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  35.3 
 
 
583 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  35.3 
 
 
583 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00034  dihydroxyacetone kinase (Eurofung)  36.75 
 
 
590 aa  265  1e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.160552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  36.03 
 
 
583 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  35.3 
 
 
583 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  33.51 
 
 
582 aa  260  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  35.3 
 
 
583 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  35.47 
 
 
583 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  35.3 
 
 
583 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  35.47 
 
 
583 aa  259  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  35.14 
 
 
583 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  35.47 
 
 
583 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04180  dihydroxyacetone kinase 1, putative  34.36 
 
 
591 aa  256  8e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.12537  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08050  glycerone kinase, putative  33.56 
 
 
600 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.81 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.82 
 
 
332 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  35.47 
 
 
544 aa  239  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.96 
 
 
332 aa  229  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  34.84 
 
 
546 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.08 
 
 
332 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31117  dihydroxyacetone kinase isoenzyme I  29.63 
 
 
597 aa  220  6e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.96 
 
 
332 aa  219  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.26 
 
 
333 aa  218  2.9999999999999998e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.87 
 
 
322 aa  217  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.87 
 
 
322 aa  217  4e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.34 
 
 
329 aa  217  5e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.54 
 
 
332 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.83 
 
 
332 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.2 
 
 
320 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  39.35 
 
 
332 aa  213  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.54 
 
 
330 aa  213  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.74 
 
 
333 aa  209  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.94 
 
 
333 aa  209  9e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.32 
 
 
331 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.44 
 
 
331 aa  203  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  34.92 
 
 
581 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.18 
 
 
333 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  33.1 
 
 
544 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  32.92 
 
 
544 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  32.92 
 
 
544 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.95 
 
 
332 aa  200  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.31 
 
 
333 aa  199  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.82 
 
 
330 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  32.71 
 
 
598 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  34.44 
 
 
568 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.73 
 
 
325 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53027  Dihydroxyacetone kinase 1 (Glycerone kinase 1) (DHA kinase 1)  28.98 
 
 
595 aa  194  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.13 
 
 
354 aa  194  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  36.24 
 
 
560 aa  193  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  40 
 
 
333 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.57 
 
 
364 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.18 
 
 
333 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  32.46 
 
 
587 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  34.86 
 
 
573 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  35.19 
 
 
571 aa  189  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  33.59 
 
 
581 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  33.59 
 
 
581 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  33.78 
 
 
581 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.57 
 
 
355 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.19 
 
 
329 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.19 
 
 
329 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.9 
 
 
333 aa  187  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.05 
 
 
331 aa  186  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.15 
 
 
354 aa  186  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.03 
 
 
354 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1052  DhaKLM operon coactivator DhaQ  36.01 
 
 
332 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00716386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0905  DhaKLM operon coactivator DhaQ  36.36 
 
 
332 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0963  DhaKLM operon coactivator DhaQ  36.36 
 
 
332 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  32.42 
 
 
616 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0873  DhaKLM operon coactivator DhaQ  36.01 
 
 
332 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1132  DhaKLM operon coactivator DhaQ  36.47 
 
 
332 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>