287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3559 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3559  Glycerone kinase  100 
 
 
549 aa  1020    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.463491  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2889  Glycerone kinase  60.52 
 
 
542 aa  535  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2432  Glycerone kinase  56.39 
 
 
547 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739383  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0963  Glycerone kinase  62.75 
 
 
545 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459045  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2167  Glycerone kinase  55.87 
 
 
544 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1031  Glycerone kinase  62.23 
 
 
545 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593318  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2726  Glycerone kinase  53.22 
 
 
556 aa  486  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0893  Glycerone kinase  53.23 
 
 
546 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1158  Glycerone kinase  62.41 
 
 
545 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263533  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  50.19 
 
 
548 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4584  Glycerone kinase  45.8 
 
 
539 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150824  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2326  Glycerone kinase  44.84 
 
 
562 aa  372  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  44.83 
 
 
567 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  45.5 
 
 
567 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  39.42 
 
 
580 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  36.9 
 
 
577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  43.7 
 
 
566 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  45.13 
 
 
616 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  43.63 
 
 
567 aa  276  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  44.58 
 
 
572 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  42.56 
 
 
566 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  42.49 
 
 
569 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  42.49 
 
 
569 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  44.66 
 
 
616 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  44.39 
 
 
570 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  44.83 
 
 
570 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  44.39 
 
 
570 aa  263  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08050  glycerone kinase, putative  32.68 
 
 
600 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  31.58 
 
 
582 aa  250  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04180  dihydroxyacetone kinase 1, putative  35.35 
 
 
591 aa  246  8e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.12537  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00034  dihydroxyacetone kinase (Eurofung)  35.6 
 
 
590 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.160552 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57462  dihydroxyacetone kinase  32.36 
 
 
595 aa  244  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0972297  normal  0.404993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  33.16 
 
 
583 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  32.88 
 
 
583 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  36.48 
 
 
546 aa  240  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  32.26 
 
 
583 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  32.26 
 
 
583 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  31.99 
 
 
583 aa  230  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  31.93 
 
 
583 aa  230  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  32.32 
 
 
583 aa  229  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  32.15 
 
 
583 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  32.39 
 
 
583 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.22 
 
 
329 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  32.05 
 
 
583 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.24 
 
 
320 aa  227  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  31.6 
 
 
583 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.88 
 
 
322 aa  220  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.88 
 
 
322 aa  220  5e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31117  dihydroxyacetone kinase isoenzyme I  28.29 
 
 
597 aa  215  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.3 
 
 
332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.42 
 
 
332 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  34.17 
 
 
544 aa  213  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  40.11 
 
 
560 aa  212  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  36.53 
 
 
581 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.12 
 
 
325 aa  200  5e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.01 
 
 
329 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  36.16 
 
 
581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  36.16 
 
 
581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  42.17 
 
 
332 aa  197  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.83 
 
 
332 aa  193  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  35.97 
 
 
581 aa  193  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  36.12 
 
 
544 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.17 
 
 
333 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  35.94 
 
 
544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  35.94 
 
 
544 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  36.93 
 
 
572 aa  189  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.1 
 
 
332 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.52 
 
 
333 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.27 
 
 
333 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.81 
 
 
333 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  32.54 
 
 
598 aa  186  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  32.63 
 
 
612 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  33.97 
 
 
569 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.74 
 
 
330 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.51 
 
 
331 aa  184  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53027  Dihydroxyacetone kinase 1 (Glycerone kinase 1) (DHA kinase 1)  26.41 
 
 
595 aa  183  6e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.91 
 
 
332 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.1 
 
 
332 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.75 
 
 
333 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  37.15 
 
 
587 aa  181  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.17 
 
 
355 aa  180  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.67 
 
 
330 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.14 
 
 
332 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.05 
 
 
333 aa  178  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  35.91 
 
 
331 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.96 
 
 
354 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  39.53 
 
 
335 aa  177  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.98 
 
 
330 aa  177  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  31.62 
 
 
589 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  32.61 
 
 
364 aa  175  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.06 
 
 
333 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0873  DhaKLM operon coactivator DhaQ  33.53 
 
 
332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.47 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  32.87 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  35.78 
 
 
573 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  39.2 
 
 
333 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.82 
 
 
329 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.82 
 
 
329 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1006  DhaKLM operon coactivator DhaQ  33.73 
 
 
332 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.795542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.94 
 
 
332 aa  173  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>