276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4584 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4584  Glycerone kinase  100 
 
 
539 aa  1086    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150824  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2167  Glycerone kinase  50.19 
 
 
544 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2432  Glycerone kinase  50.47 
 
 
547 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739383  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  48.87 
 
 
548 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2726  Glycerone kinase  48.43 
 
 
556 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0893  Glycerone kinase  48.51 
 
 
546 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2889  Glycerone kinase  49.53 
 
 
542 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0963  Glycerone kinase  47.62 
 
 
545 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459045  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1031  Glycerone kinase  47.52 
 
 
545 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593318  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1158  Glycerone kinase  48.99 
 
 
545 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263533  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2326  Glycerone kinase  41.86 
 
 
562 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3559  Glycerone kinase  44.32 
 
 
549 aa  354  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.463491  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  38.95 
 
 
580 aa  319  7e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  36.09 
 
 
577 aa  293  7e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  38.06 
 
 
567 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  37.7 
 
 
567 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  37.04 
 
 
566 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  35.75 
 
 
567 aa  270  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  37.88 
 
 
616 aa  269  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  36.51 
 
 
566 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  36.27 
 
 
569 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  36.27 
 
 
569 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  35.84 
 
 
572 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57462  dihydroxyacetone kinase  34.89 
 
 
595 aa  263  6.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0972297  normal  0.404993 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  32.71 
 
 
582 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  37.26 
 
 
570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  37.26 
 
 
570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04180  dihydroxyacetone kinase 1, putative  33.1 
 
 
591 aa  254  3e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.12537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  37.08 
 
 
616 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  36.91 
 
 
570 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  33.45 
 
 
583 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  33.45 
 
 
583 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  32.59 
 
 
583 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  32.47 
 
 
583 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  33.96 
 
 
583 aa  242  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  33.79 
 
 
583 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  34.06 
 
 
583 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  33.16 
 
 
583 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 
583 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  33.79 
 
 
583 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  33.62 
 
 
583 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  35.48 
 
 
546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00034  dihydroxyacetone kinase (Eurofung)  32.66 
 
 
590 aa  234  4.0000000000000004e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.160552 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31117  dihydroxyacetone kinase isoenzyme I  32.26 
 
 
597 aa  229  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.6 
 
 
329 aa  226  8e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.1 
 
 
332 aa  224  2e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  32.91 
 
 
544 aa  224  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08050  glycerone kinase, putative  31.74 
 
 
600 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.74 
 
 
322 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.74 
 
 
322 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.12 
 
 
332 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.27 
 
 
320 aa  210  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.68 
 
 
325 aa  209  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.74 
 
 
332 aa  207  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.06 
 
 
333 aa  205  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53027  Dihydroxyacetone kinase 1 (Glycerone kinase 1) (DHA kinase 1)  30.42 
 
 
595 aa  204  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  38.3 
 
 
332 aa  204  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.44 
 
 
332 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.37 
 
 
333 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.8 
 
 
332 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  33.45 
 
 
544 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.24 
 
 
329 aa  200  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.45 
 
 
333 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.75 
 
 
330 aa  199  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  33.09 
 
 
544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.2 
 
 
332 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  33.09 
 
 
544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.04 
 
 
333 aa  197  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  31.32 
 
 
616 aa  193  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  29.46 
 
 
598 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.96 
 
 
333 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  32.81 
 
 
571 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.24 
 
 
332 aa  191  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.47 
 
 
331 aa  190  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  31.94 
 
 
581 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  31.52 
 
 
581 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  31.33 
 
 
581 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  31.33 
 
 
581 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  34.74 
 
 
331 aa  187  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  31.73 
 
 
568 aa  187  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  36.14 
 
 
333 aa  187  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4228  dihydroxyacetone kinase  32.05 
 
 
572 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.05 
 
 
330 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  40 
 
 
330 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.31 
 
 
333 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.62 
 
 
331 aa  182  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  30.81 
 
 
560 aa  182  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.2 
 
 
329 aa  181  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.2 
 
 
329 aa  181  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.05 
 
 
333 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  31.69 
 
 
569 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.58 
 
 
330 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.29 
 
 
364 aa  177  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.2 
 
 
331 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  31.2 
 
 
587 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.36 
 
 
329 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.69 
 
 
354 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  30.03 
 
 
589 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29810  dihydroxyacetone kinase  31.83 
 
 
578 aa  173  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  34.78 
 
 
354 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>