293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2647 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2647  dihydroxyacetone kinase  100 
 
 
567 aa  1093    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  53.9 
 
 
581 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  53.9 
 
 
581 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  54.17 
 
 
581 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  52.63 
 
 
616 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  52.18 
 
 
581 aa  495  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  51.69 
 
 
587 aa  476  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  50.79 
 
 
568 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4222  Glycerone kinase  52.76 
 
 
576 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4228  dihydroxyacetone kinase  52.94 
 
 
572 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3953  dihydroxyacetone kinase  50.61 
 
 
587 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29810  dihydroxyacetone kinase  51.38 
 
 
578 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  51.56 
 
 
571 aa  450  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  50.78 
 
 
569 aa  451  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0184  Glycerone kinase  47.94 
 
 
612 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000456785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1547  dihydroxyacetone kinase  52.65 
 
 
585 aa  399  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.462978  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  48.48 
 
 
573 aa  385  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  54.89 
 
 
619 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  52.6 
 
 
335 aa  335  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  37.35 
 
 
598 aa  304  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  34.08 
 
 
583 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  34.08 
 
 
583 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  34.25 
 
 
583 aa  299  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  33.56 
 
 
583 aa  293  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  34.25 
 
 
583 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  34.42 
 
 
583 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  34.25 
 
 
583 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  34.25 
 
 
583 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  31.15 
 
 
582 aa  287  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  35.38 
 
 
589 aa  286  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  34.25 
 
 
583 aa  286  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  34.25 
 
 
583 aa  286  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  34.42 
 
 
583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  36.3 
 
 
588 aa  260  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  38.43 
 
 
546 aa  259  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  39.82 
 
 
335 aa  256  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  34.78 
 
 
612 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  45.05 
 
 
333 aa  253  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  38.78 
 
 
569 aa  250  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  37.92 
 
 
567 aa  249  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  37.39 
 
 
566 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  41.39 
 
 
333 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  37.17 
 
 
572 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.94 
 
 
332 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.9 
 
 
332 aa  242  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.09 
 
 
332 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  36.82 
 
 
566 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  36.6 
 
 
567 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  37.94 
 
 
570 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  37.77 
 
 
616 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  42.9 
 
 
333 aa  239  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  37.77 
 
 
570 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  37.77 
 
 
570 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  36.54 
 
 
569 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  36.54 
 
 
569 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.3 
 
 
331 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  40.3 
 
 
332 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.67 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.26 
 
 
332 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  36.04 
 
 
567 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  37.26 
 
 
616 aa  233  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  41.23 
 
 
334 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  40.92 
 
 
334 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.26 
 
 
354 aa  230  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  38.71 
 
 
334 aa  229  8e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.27 
 
 
333 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.41 
 
 
331 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.77 
 
 
331 aa  228  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.11 
 
 
354 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3761  Dak kinase  41.54 
 
 
327 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  35.06 
 
 
329 aa  226  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  33.96 
 
 
580 aa  226  6e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  39.04 
 
 
333 aa  226  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.97 
 
 
333 aa  225  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.36 
 
 
333 aa  225  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  30.27 
 
 
577 aa  224  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.54 
 
 
354 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  39.04 
 
 
694 aa  223  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  40.73 
 
 
331 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  37.61 
 
 
695 aa  223  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  36.86 
 
 
694 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.27 
 
 
332 aa  221  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  36.89 
 
 
334 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  38.37 
 
 
700 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  35.35 
 
 
333 aa  220  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0620  Glycerone kinase  45.95 
 
 
336 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.91 
 
 
332 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.39 
 
 
333 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  33.05 
 
 
355 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  32.48 
 
 
544 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  32.96 
 
 
364 aa  217  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.08 
 
 
329 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.61 
 
 
333 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  34.54 
 
 
572 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  34.28 
 
 
544 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.67 
 
 
329 aa  212  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  37.16 
 
 
333 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.67 
 
 
327 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0963  Glycerone kinase  38.42 
 
 
545 aa  211  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459045  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  33.92 
 
 
544 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>