More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20750 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20750  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  100 
 
 		 488 aa  950    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0330328  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6995  amino acid permease-associated region  43.18 
 
 		 496 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6330  amino acid permease-associated region  42.98 
 
 		 496 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.80372  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1499  amino acid permease-associated region  42.98 
 
 		 617 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2147  L-asparagine permease  42.79 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2256  amino acid permease-associated region  42.79 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2127  L-asparagine permease  42.79 
 
 		 509 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.560238  normal  0.0398116 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1718  L-asparagine permease  41.56 
 
 		 499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01410  L-asparagine transporter  41.56 
 
 		 499 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00425932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2193  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 		 499 aa  353  4e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1540  L-asparagine permease  41.56 
 
 		 499 aa  353  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01421  hypothetical protein  41.56 
 
 		 499 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00419609  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1725  L-asparagine permease  41.56 
 
 		 499 aa  353  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.572369  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2059  L-asparagine permease  41.56 
 
 		 499 aa  353  4e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0501349  hitchhiker  0.00455719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2206  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 		 499 aa  353  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000670544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1635  L-asparagine permease  41.56 
 
 		 499 aa  353  5e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968889  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3032  amino acid permease-associated region  40.04 
 
 		 485 aa  350  3e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3209  amino acid permease-associated region  41.72 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190621  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3417  amino acid permease-associated region  42.47 
 
 		 483 aa  349  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595169  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3965  amino acid permease-associated region  42.47 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1576  L-asparagine permease  41.34 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000285451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1757  L-asparagine permease  41.34 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000130352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1763  L-asparagine permease  41.34 
 
 		 497 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0655306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1699  L-asparagine permease  41.34 
 
 		 497 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000238766  normal  0.347995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1702  L-asparagine permease  41.34 
 
 		 497 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000149033  normal  0.155266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0873  amino acid permease-associated region  43.27 
 
 		 483 aa  347  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2097  amino acid permease-associated region  41.93 
 
 		 498 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0831928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3458  amino acid permease-associated region  42.19 
 
 		 497 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.71207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1983  amino acid transporter  41.29 
 
 		 503 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2891  L-asparagine permease  40.43 
 
 		 473 aa  342  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4301  amino acid permease-associated region  42.54 
 
 		 501 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4065  amino acid permease-associated region  42.54 
 
 		 501 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3270  amino acid permease-associated region  41.21 
 
 		 475 aa  341  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1591  amino acid permease-associated region  43.51 
 
 		 534 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00340007  normal  0.272695 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3457  amino acid permease-associated region  42.89 
 
 		 501 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3069  amino acid permease-associated region  43.1 
 
 		 486 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0454  amino acid permease-associated region  41.61 
 
 		 494 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1347  amino acid permease-associated region  43.53 
 
 		 487 aa  333  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000251432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1554  amino acid permease-associated region  40.38 
 
 		 491 aa  330  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3273  amino acid permease-associated region  42.01 
 
 		 486 aa  325  9e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3977  amino acid permease-associated region  42.33 
 
 		 516 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10351  L-asparagine permease ansP2  41.1 
 
 		 487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  40.27 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1741  amino acid permease-associated region  40.85 
 
 		 523 aa  309  9e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3759  amino acid permease-associated region  39.66 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1301  amino acid permease-associated region  39.91 
 
 		 534 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259093  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3400  amino acid permease-associated region  42.31 
 
 		 489 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12159  L-asparagine permease ansP1  39.96 
 
 		 489 aa  296  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0029057  normal  0.731439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3549  amino acid permease-associated region  38.43 
 
 		 504 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4431  amino acid permease-associated region  41.27 
 
 		 495 aa  287  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  38.97 
 
 		 455 aa  280  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  38.55 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  38.55 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  38.55 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3053  amino acid permease-associated region  37.13 
 
 		 470 aa  271  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  34.64 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3070  phenylalanine transporter  37.13 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00537  phenylalanine transporter  37.07 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00526  hypothetical protein  37.07 
 
 		 458 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0623  phenylalanine transporter  37.07 
 
 		 458 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0943118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0594  phenylalanine transporter  37.07 
 
 		 458 aa  270  5e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454121  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0470  phenylalanine transporter  37.07 
 
 		 458 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0657  phenylalanine transporter  36.9 
 
 		 470 aa  269  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1887  amino acid permease-associated region  37.5 
 
 		 466 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0487  amino acid transporter  36.77 
 
 		 466 aa  266  5e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.219434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4013  amino acid permease-associated region  36.71 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82914  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0594  phenylalanine transporter  36.84 
 
 		 458 aa  266  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1059  phenylalanine transporter  36.88 
 
 		 462 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0671  amino acid permease-associated region  37.65 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  37.35 
 
 		 468 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  34.51 
 
 		 449 aa  265  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  37.35 
 
 		 468 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  37.35 
 
 		 468 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2394  aromatic amino acid transport protein  37.56 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245108  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  37.59 
 
 		 468 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0658  aromatic amino acid transporter  36.62 
 
 		 456 aa  264  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.189383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0735  phenylalanine transporter  36.65 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0613  phenylalanine transporter  36.65 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0620  phenylalanine transporter  36.65 
 
 		 464 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.455988 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1186  aromatic amino acid transport protein AroP  37.56 
 
 		 461 aa  264  3e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0669  phenylalanine transporter  36.65 
 
 		 464 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0065  amino acid transporter  34.63 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0679  phenylalanine transporter  36.65 
 
 		 464 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0666  aromatic amino acid transport protein  37.32 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.181372  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  37.32 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  37.32 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0799  aromatic amino acid transport protein AroP  37.32 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.578229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  37.12 
 
 		 468 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  37.12 
 
 		 468 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  37.12 
 
 		 468 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  37.12 
 
 		 468 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0927  amino acid ABC transporter permease  36.83 
 
 		 453 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4288  amino acid permease-associated region  36.66 
 
 		 451 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0118  aromatic amino acid transporter  36.9 
 
 		 456 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0360235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3756  amino acid permease-associated region  37.85 
 
 		 452 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0213954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0967  amino acid permease-associated region  36.83 
 
 		 453 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.695825  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3570  amino acid permease-associated region  37.85 
 
 		 452 aa  262  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5754  amino acid permease-associated region  42.62 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  normal  0.385006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  36.43 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  36.43 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>