More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3549 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3759  amino acid permease-associated region  85.57 
 
 		 504 aa  848    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1301  amino acid permease-associated region  69.4 
 
 		 534 aa  695    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259093  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3549  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 504 aa  1005    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3977  amino acid permease-associated region  74.28 
 
 		 516 aa  707    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3400  amino acid permease-associated region  66.02 
 
 		 489 aa  622  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0454  amino acid permease-associated region  62.68 
 
 		 494 aa  595  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1554  amino acid permease-associated region  59.96 
 
 		 491 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10351  L-asparagine permease ansP2  60.33 
 
 		 487 aa  569  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4431  amino acid permease-associated region  64.29 
 
 		 495 aa  569  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4301  amino acid permease-associated region  59.17 
 
 		 501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4065  amino acid permease-associated region  59.17 
 
 		 501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1983  amino acid transporter  58.66 
 
 		 503 aa  561  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3032  amino acid permease-associated region  58.07 
 
 		 485 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3965  amino acid permease-associated region  59.62 
 
 		 497 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12159  L-asparagine permease ansP1  63.05 
 
 		 489 aa  554  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0029057  normal  0.731439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3457  amino acid permease-associated region  60.57 
 
 		 501 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2147  L-asparagine permease  57.98 
 
 		 509 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2127  L-asparagine permease  57.98 
 
 		 509 aa  551  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.560238  normal  0.0398116 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2256  amino acid permease-associated region  57.98 
 
 		 509 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3458  amino acid permease-associated region  59.4 
 
 		 497 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.71207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3209  amino acid permease-associated region  56.07 
 
 		 485 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01410  L-asparagine transporter  58.4 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00425932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2206  amino acid permease-associated region  58.4 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000670544  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2193  amino acid permease-associated region  58.4 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1540  L-asparagine permease  58.4 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2059  L-asparagine permease  58.4 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0501349  hitchhiker  0.00455719 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5754  amino acid permease-associated region  63.73 
 
 		 490 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  normal  0.385006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01421  hypothetical protein  58.4 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00419609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1635  L-asparagine permease  58.4 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1718  L-asparagine permease  58.4 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1725  L-asparagine permease  58.4 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.572369  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2097  amino acid permease-associated region  60.13 
 
 		 498 aa  534  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0831928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6995  amino acid permease-associated region  60.78 
 
 		 496 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1499  amino acid permease-associated region  60.61 
 
 		 617 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6330  amino acid permease-associated region  61 
 
 		 496 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.80372  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3417  amino acid permease-associated region  54.66 
 
 		 483 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595169  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1699  L-asparagine permease  58.73 
 
 		 497 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000238766  normal  0.347995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0873  amino acid permease-associated region  54.2 
 
 		 483 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1763  L-asparagine permease  58.52 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0655306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1576  L-asparagine permease  58.52 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000285451  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1702  L-asparagine permease  58.52 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000149033  normal  0.155266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1757  L-asparagine permease  58.52 
 
 		 497 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000130352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1347  amino acid permease-associated region  57.44 
 
 		 487 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000251432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2891  L-asparagine permease  56.67 
 
 		 473 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3270  amino acid permease-associated region  51.97 
 
 		 475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1591  amino acid permease-associated region  45.14 
 
 		 534 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00340007  normal  0.272695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3069  amino acid permease-associated region  48.52 
 
 		 486 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3273  amino acid permease-associated region  48.17 
 
 		 486 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  45.54 
 
 		 475 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1741  amino acid permease-associated region  46.36 
 
 		 523 aa  365  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  39.87 
 
 		 462 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  40.43 
 
 		 463 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  40.43 
 
 		 463 aa  339  7e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  40.43 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  40.43 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  40.43 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  40.43 
 
 		 463 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  40.22 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  39.5 
 
 		 459 aa  337  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  40.22 
 
 		 463 aa  336  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  40.22 
 
 		 463 aa  336  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  40 
 
 		 463 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  38.02 
 
 		 449 aa  334  2e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  39.48 
 
 		 463 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  38.79 
 
 		 464 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  38.27 
 
 		 452 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  39.38 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  37.96 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  40.64 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  39.82 
 
 		 468 aa  323  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  41.46 
 
 		 468 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  41.46 
 
 		 468 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  41.46 
 
 		 468 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1817  aromatic amino acid permease  37.02 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  41.23 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4013  amino acid permease-associated region  36.64 
 
 		 460 aa  320  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82914  normal  0.390914 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  41.23 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  41.23 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  41.23 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2477  amino acid permease-associated region  37.53 
 
 		 457 aa  320  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.176999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1665  aromatic amino acid transporter  37.53 
 
 		 457 aa  320  5e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000114878  normal  0.317193 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2381  aromatic amino acid transport protein AroP  37.53 
 
 		 457 aa  320  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000248721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0705  amino acid permease-associated region  37.61 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3580  amino acid permease-associated region  38.84 
 
 		 469 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.90045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1493  amino acid permease-associated region  37.99 
 
 		 472 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53050  aromatic amino acid transport protein AroP2  38.08 
 
 		 472 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0105  aromatic amino acid transporter  39.37 
 
 		 456 aa  318  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3490  amino acid permease-associated region  39.37 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.475795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3547  aromatic amino acid transporter  39.37 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0288146  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0115  aromatic amino acid transporter  39.37 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.329047 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0116  aromatic amino acid transporter  39.37 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000572779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3501  amino acid permease-associated region  37.04 
 
 		 461 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00111  aromatic amino acid transporter  39.37 
 
 		 457 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00136665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00110  hypothetical protein  39.37 
 
 		 457 aa  317  4e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00481643  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  36.99 
 
 		 466 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0163  aromatic amino acid transporter  38.21 
 
 		 456 aa  315  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3756  amino acid permease-associated region  37.36 
 
 		 452 aa  315  9e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0213954  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3570  amino acid permease-associated region  36.7 
 
 		 452 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1110  aromatic amino acid transport protein AroP  38.05 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1763  aromatic amino acid transport protein AroP  38.05 
 
 		 461 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.99301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>