More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0454 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0454  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 494 aa  986    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12159  L-asparagine permease ansP1  68.99 
 
 		 489 aa  636    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0029057  normal  0.731439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1554  amino acid permease-associated region  65.84 
 
 		 491 aa  634  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10351  L-asparagine permease ansP2  66.88 
 
 		 487 aa  630  1e-179  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3977  amino acid permease-associated region  64.87 
 
 		 516 aa  627  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4431  amino acid permease-associated region  67.82 
 
 		 495 aa  612  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1301  amino acid permease-associated region  63.6 
 
 		 534 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259093  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3759  amino acid permease-associated region  61.8 
 
 		 504 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3400  amino acid permease-associated region  64.07 
 
 		 489 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2256  amino acid permease-associated region  59.96 
 
 		 509 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2127  L-asparagine permease  59.96 
 
 		 509 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.560238  normal  0.0398116 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2147  L-asparagine permease  59.96 
 
 		 509 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3209  amino acid permease-associated region  59.42 
 
 		 485 aa  579  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01410  L-asparagine transporter  59.59 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00425932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2193  amino acid permease-associated region  59.59 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1540  L-asparagine permease  59.59 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1725  L-asparagine permease  59.59 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.572369  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01421  hypothetical protein  59.59 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00419609  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1635  L-asparagine permease  59.59 
 
 		 499 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968889  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2059  L-asparagine permease  59.59 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0501349  hitchhiker  0.00455719 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2206  amino acid permease-associated region  59.59 
 
 		 499 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000670544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2097  amino acid permease-associated region  61.3 
 
 		 498 aa  572  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0831928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1718  L-asparagine permease  61.67 
 
 		 499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3032  amino acid permease-associated region  58.49 
 
 		 485 aa  571  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1699  L-asparagine permease  62.96 
 
 		 497 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000238766  normal  0.347995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1757  L-asparagine permease  62.74 
 
 		 497 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000130352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1576  L-asparagine permease  62.74 
 
 		 497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000285451  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1763  L-asparagine permease  62.74 
 
 		 497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0655306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1702  L-asparagine permease  62.74 
 
 		 497 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000149033  normal  0.155266 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4301  amino acid permease-associated region  59.19 
 
 		 501 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3549  amino acid permease-associated region  62.68 
 
 		 504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4065  amino acid permease-associated region  59.19 
 
 		 501 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0873  amino acid permease-associated region  59.49 
 
 		 483 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3417  amino acid permease-associated region  58.04 
 
 		 483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595169  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3457  amino acid permease-associated region  60.13 
 
 		 501 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1983  amino acid transporter  57.35 
 
 		 503 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3965  amino acid permease-associated region  56.26 
 
 		 497 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3458  amino acid permease-associated region  57.42 
 
 		 497 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.71207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1499  amino acid permease-associated region  59.83 
 
 		 617 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6330  amino acid permease-associated region  58.25 
 
 		 496 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.80372  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6995  amino acid permease-associated region  60.04 
 
 		 496 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1347  amino acid permease-associated region  59.58 
 
 		 487 aa  534  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000251432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5754  amino acid permease-associated region  60.33 
 
 		 490 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  normal  0.385006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2891  L-asparagine permease  50.74 
 
 		 473 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3270  amino acid permease-associated region  52.43 
 
 		 475 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1591  amino acid permease-associated region  50.31 
 
 		 534 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00340007  normal  0.272695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1741  amino acid permease-associated region  45.79 
 
 		 523 aa  391  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88748  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3069  amino acid permease-associated region  44.68 
 
 		 486 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3273  amino acid permease-associated region  45.03 
 
 		 486 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  41.88 
 
 		 475 aa  346  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20750  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  41.61 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0330328  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  40.05 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  40.22 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  40.76 
 
 		 463 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  39.81 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  40.52 
 
 		 463 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  39.43 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.66 
 
 		 468 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  40.52 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  38.75 
 
 		 463 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.45 
 
 		 468 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  40.28 
 
 		 463 aa  319  9e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  40.28 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  40.28 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  40.28 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  40.28 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  40.05 
 
 		 463 aa  316  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  39.6 
 
 		 468 aa  316  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  37.42 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.04 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.04 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.04 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.04 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  39.04 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  39.57 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  39.81 
 
 		 463 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  37.66 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  38.3 
 
 		 461 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  40.27 
 
 		 471 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  37.9 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  37.63 
 
 		 473 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  40.05 
 
 		 471 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  38.35 
 
 		 447 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  38.35 
 
 		 447 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  38.35 
 
 		 447 aa  312  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  40.09 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  37.9 
 
 		 470 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  40.09 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  40.09 
 
 		 468 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  37.21 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  38.13 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  38.13 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  38.13 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  38.13 
 
 		 467 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  38.13 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  37.69 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  38.13 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  38.13 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  39.86 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  39.86 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>