More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3458 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2256  amino acid permease-associated region  67.79 
 
 		 509 aa  675    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3965  amino acid permease-associated region  98.59 
 
 		 497 aa  976    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6995  amino acid permease-associated region  70.34 
 
 		 496 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3417  amino acid permease-associated region  65.83 
 
 		 483 aa  672    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1983  amino acid transporter  92.2 
 
 		 503 aa  921    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2147  L-asparagine permease  67.79 
 
 		 509 aa  675    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3209  amino acid permease-associated region  65.55 
 
 		 485 aa  670    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0873  amino acid permease-associated region  66.11 
 
 		 483 aa  675    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1499  amino acid permease-associated region  67.2 
 
 		 617 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888764  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4301  amino acid permease-associated region  92 
 
 		 501 aa  918    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3458  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 497 aa  989    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.71207 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2127  L-asparagine permease  67.79 
 
 		 509 aa  675    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.560238  normal  0.0398116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3457  amino acid permease-associated region  92 
 
 		 501 aa  890    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4065  amino acid permease-associated region  92 
 
 		 501 aa  918    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6330  amino acid permease-associated region  69.15 
 
 		 496 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.80372  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3032  amino acid permease-associated region  65.48 
 
 		 485 aa  665    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01410  L-asparagine transporter  63.69 
 
 		 499 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00425932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2193  amino acid permease-associated region  63.69 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2097  amino acid permease-associated region  64.92 
 
 		 498 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0831928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2059  L-asparagine permease  63.69 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0501349  hitchhiker  0.00455719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1718  L-asparagine permease  64.6 
 
 		 499 aa  631  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01421  hypothetical protein  63.69 
 
 		 499 aa  633  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00419609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1540  L-asparagine permease  63.69 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2206  amino acid permease-associated region  63.69 
 
 		 499 aa  633  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000670544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1635  L-asparagine permease  63.69 
 
 		 499 aa  633  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1725  L-asparagine permease  63.69 
 
 		 499 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.572369  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1763  L-asparagine permease  65.01 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0655306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1702  L-asparagine permease  64.8 
 
 		 497 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000149033  normal  0.155266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1757  L-asparagine permease  64.8 
 
 		 497 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000130352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1576  L-asparagine permease  65.01 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000285451  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1699  L-asparagine permease  65.01 
 
 		 497 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000238766  normal  0.347995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1347  amino acid permease-associated region  68.14 
 
 		 487 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000251432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1301  amino acid permease-associated region  60.41 
 
 		 534 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.259093  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3977  amino acid permease-associated region  63.52 
 
 		 516 aa  570  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3759  amino acid permease-associated region  57.94 
 
 		 504 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3400  amino acid permease-associated region  59.21 
 
 		 489 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0454  amino acid permease-associated region  57.42 
 
 		 494 aa  541  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10351  L-asparagine permease ansP2  58.77 
 
 		 487 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1554  amino acid permease-associated region  59.06 
 
 		 491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3549  amino acid permease-associated region  62.12 
 
 		 504 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12159  L-asparagine permease ansP1  58.6 
 
 		 489 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0029057  normal  0.731439 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5754  amino acid permease-associated region  58.84 
 
 		 490 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.263721  normal  0.385006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4431  amino acid permease-associated region  58.64 
 
 		 495 aa  488  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2891  L-asparagine permease  53.03 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3270  amino acid permease-associated region  52.11 
 
 		 475 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1591  amino acid permease-associated region  49.32 
 
 		 534 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00340007  normal  0.272695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3069  amino acid permease-associated region  46.44 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3273  amino acid permease-associated region  46.87 
 
 		 486 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  44.61 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1741  amino acid permease-associated region  44.24 
 
 		 523 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88748  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1325  amino acid permease-associated region  41.01 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00135796  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  43.13 
 
 		 459 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  38.15 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  42.39 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  42.39 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  42.39 
 
 		 463 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  42.39 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  42.39 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  43.33 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  43.33 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  43.33 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  42.31 
 
 		 463 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  41.83 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  39.91 
 
 		 461 aa  346  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  43.1 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  43.1 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  43.1 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  40.48 
 
 		 485 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  43.1 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  42.79 
 
 		 463 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  41.83 
 
 		 463 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  42.89 
 
 		 468 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0665  amino acid permease-associated region  39.24 
 
 		 459 aa  343  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  42.55 
 
 		 463 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  40.77 
 
 		 461 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  42.07 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  40.26 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  41.37 
 
 		 447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  41.37 
 
 		 447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  41.37 
 
 		 447 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20750  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  43.2 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0330328  normal  0.125199 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  42.59 
 
 		 449 aa  337  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0065  amino acid transporter  42.93 
 
 		 463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  40.09 
 
 		 462 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0103  gamma-aminobutyrate permease related permease  41.93 
 
 		 449 aa  335  1e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000103198  hitchhiker  0.00000046337 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  42.52 
 
 		 460 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  42.52 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  42.52 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  42.52 
 
 		 460 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2825  amino acid permease-associated region  40.09 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0197973  hitchhiker  0.0017398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  39.5 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54040  amino acid permease  41.57 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  38.74 
 
 		 464 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4729  amino acid permease  41.57 
 
 		 471 aa  329  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.735524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1089  amino acid permease-associated region  40.73 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  41.15 
 
 		 468 aa  326  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  40.9 
 
 		 467 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1059  amino acid permease-associated region  41.59 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4926  aromatic amino acid transport protein  39.78 
 
 		 462 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262664  normal  0.164977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1100  amino acid permease-associated region  41.59 
 
 		 472 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0119846  normal  0.968879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>