More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  100 
 
 
351 aa  696    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  61.74 
 
 
344 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  55.43 
 
 
343 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  57.93 
 
 
368 aa  349  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  52.72 
 
 
368 aa  345  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  57.64 
 
 
349 aa  323  4e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  35.85 
 
 
364 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.46 
 
 
373 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.31 
 
 
404 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  38.01 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  40 
 
 
357 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  41.5 
 
 
350 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  39.54 
 
 
350 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  39.22 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  39.22 
 
 
350 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  37.24 
 
 
355 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  38.38 
 
 
382 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  33.15 
 
 
353 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  35.4 
 
 
360 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  31.48 
 
 
393 aa  155  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.69 
 
 
393 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.01 
 
 
378 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  42.3 
 
 
396 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  37.32 
 
 
369 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  37.46 
 
 
360 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  37.57 
 
 
378 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  37.35 
 
 
413 aa  153  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36.51 
 
 
357 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  29.13 
 
 
362 aa  152  8e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  33.44 
 
 
350 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  33.62 
 
 
354 aa  152  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.64 
 
 
361 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  37.26 
 
 
352 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.7 
 
 
357 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.33 
 
 
350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  28.85 
 
 
362 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  32.26 
 
 
349 aa  146  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.83 
 
 
377 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.11 
 
 
350 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.55 
 
 
364 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36 
 
 
366 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  38.57 
 
 
399 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  36 
 
 
306 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36 
 
 
306 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.81 
 
 
350 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  36.77 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  28.27 
 
 
350 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  27.88 
 
 
359 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.97 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  35.55 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  32.26 
 
 
656 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  30.56 
 
 
361 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  31.54 
 
 
362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  30.99 
 
 
350 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  29.85 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  33.23 
 
 
353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  38.49 
 
 
359 aa  125  9e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  30.26 
 
 
394 aa  124  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.41 
 
 
373 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.54 
 
 
376 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  30.72 
 
 
366 aa  122  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  34.24 
 
 
378 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.12 
 
 
349 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.64 
 
 
370 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.46 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.07 
 
 
363 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  32.72 
 
 
349 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  32.72 
 
 
349 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  29.62 
 
 
350 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.02 
 
 
365 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.34 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  31.62 
 
 
409 aa  96.3  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.66 
 
 
355 aa  95.9  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  25.37 
 
 
406 aa  92.8  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  25.6 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  25.9 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.25 
 
 
344 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  31.05 
 
 
347 aa  85.9  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1613  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.43 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.81 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00187738  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1100  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  35.29 
 
 
332 aa  63.2  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.12 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1326  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.76 
 
 
325 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0689  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.7 
 
 
362 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0656  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.55 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0602  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.23 
 
 
311 aa  60.5  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2329  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.3 
 
 
326 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2037  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.55 
 
 
332 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0748  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.55 
 
 
332 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2054  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.3 
 
 
326 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.328205 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000084  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III protein 2  24.44 
 
 
364 aa  59.7  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61467  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5526  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.71 
 
 
332 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.386832  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1932  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.55 
 
 
332 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543004  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5766  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.71 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0823  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.77 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10544  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.76 
 
 
335 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.66749e-72  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1334  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  27.61 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3101  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.48 
 
 
330 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5065  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.01 
 
 
333 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.39 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.732664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>