248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2104 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  100 
 
 
361 aa  705    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  55.87 
 
 
357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  50.84 
 
 
352 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  49.3 
 
 
364 aa  319  6e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  47.5 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  49.03 
 
 
350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  49.03 
 
 
350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  49.86 
 
 
350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  46.8 
 
 
357 aa  298  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  46.5 
 
 
353 aa  295  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  46.2 
 
 
366 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  46.78 
 
 
353 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  48.04 
 
 
350 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  47.38 
 
 
373 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  43.82 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  48.06 
 
 
306 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  48.06 
 
 
306 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  41.06 
 
 
354 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  45.25 
 
 
355 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  48.76 
 
 
359 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  42.54 
 
 
378 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  42.42 
 
 
369 aa  222  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  42.25 
 
 
378 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.03 
 
 
350 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  36.46 
 
 
354 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  34.64 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  31.84 
 
 
373 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  32.18 
 
 
350 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.89 
 
 
355 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.38 
 
 
373 aa  186  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  31.07 
 
 
394 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.36 
 
 
350 aa  179  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  40.25 
 
 
344 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.29 
 
 
350 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  33.15 
 
 
350 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.12 
 
 
350 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.05 
 
 
350 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.17 
 
 
370 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  26.4 
 
 
359 aa  157  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  32.57 
 
 
352 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  34.27 
 
 
349 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.99 
 
 
349 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  34.59 
 
 
343 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.46 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  32.62 
 
 
368 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  34.63 
 
 
347 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  27.64 
 
 
362 aa  146  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  28.03 
 
 
362 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  28.85 
 
 
393 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  33.64 
 
 
351 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  28.8 
 
 
363 aa  136  5e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  26.54 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  28.46 
 
 
364 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.73 
 
 
377 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  33.05 
 
 
378 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  29.88 
 
 
357 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.62 
 
 
393 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  33.23 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  28.42 
 
 
382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  28.03 
 
 
404 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  28.74 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.74 
 
 
368 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  30.49 
 
 
366 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.71 
 
 
363 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  26.22 
 
 
349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  35.24 
 
 
349 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  24.54 
 
 
656 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  31.67 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.37 
 
 
365 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  32.41 
 
 
354 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  25.27 
 
 
360 aa  102  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.69 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.89 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  23.08 
 
 
406 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  26.2 
 
 
409 aa  86.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  22.96 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.65 
 
 
376 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  25 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1100  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.69 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4809  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.48 
 
 
315 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0509629  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0229  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.43 
 
 
330 aa  65.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1605  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.29 
 
 
310 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3112  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  23.74 
 
 
325 aa  63.2  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0271705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.38 
 
 
321 aa  62.8  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.380869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1099  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.32 
 
 
417 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1136  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.13 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.896107  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5526  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.35 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.386832  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1043  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.95 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0109736 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5766  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.26 
 
 
332 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2037  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.42 
 
 
332 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0748  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.42 
 
 
332 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1324  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.45 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.760998  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1374  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.23 
 
 
322 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2003  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.96 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0749  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.77 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000257819  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1348  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  23.62 
 
 
317 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26714  beta ketoacyl-coa synthase  23.76 
 
 
545 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1344  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  23.62 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4114  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.19 
 
 
310 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6224  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.57 
 
 
330 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379865  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>