206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5115 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  100 
 
 
364 aa  707    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  57.89 
 
 
360 aa  381  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  60.4 
 
 
352 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  57.43 
 
 
350 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  57.14 
 
 
350 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  57.14 
 
 
350 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  58.52 
 
 
373 aa  360  2e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  56.7 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  56.02 
 
 
357 aa  352  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  54.7 
 
 
353 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  58.24 
 
 
350 aa  336  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  49.3 
 
 
361 aa  322  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  51.39 
 
 
357 aa  319  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  46.61 
 
 
354 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  48.74 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  46.57 
 
 
349 aa  298  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  51.31 
 
 
306 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  51.31 
 
 
306 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  49.14 
 
 
355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  46.93 
 
 
378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  46.52 
 
 
369 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  46.93 
 
 
378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  48.18 
 
 
359 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  37.61 
 
 
354 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  36.89 
 
 
373 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.9 
 
 
350 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  39.56 
 
 
355 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  40.85 
 
 
350 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.68 
 
 
350 aa  202  8e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.59 
 
 
350 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  34.93 
 
 
350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  35.11 
 
 
350 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.39 
 
 
350 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  34.37 
 
 
394 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  29.92 
 
 
359 aa  189  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  35 
 
 
350 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  39.22 
 
 
370 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  38.55 
 
 
378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  38.07 
 
 
347 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  33.8 
 
 
349 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.52 
 
 
349 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.95 
 
 
373 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.35 
 
 
352 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.33 
 
 
377 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  35.01 
 
 
344 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  34.73 
 
 
366 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.23 
 
 
368 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  32.18 
 
 
343 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  33.55 
 
 
351 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  29.94 
 
 
393 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.76 
 
 
404 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.83 
 
 
365 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  25.9 
 
 
362 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.34 
 
 
349 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.77 
 
 
363 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  26.58 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  27.3 
 
 
362 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  28.65 
 
 
382 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.77 
 
 
393 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  32.31 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  31.58 
 
 
364 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  26.26 
 
 
656 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.24 
 
 
354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  30.18 
 
 
357 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  28.18 
 
 
404 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  30 
 
 
363 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  28.57 
 
 
361 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  33.72 
 
 
396 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.94 
 
 
344 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  27.76 
 
 
399 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.58 
 
 
368 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  30.21 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  26.5 
 
 
406 aa  100  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  27.34 
 
 
406 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.47 
 
 
349 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  26.33 
 
 
406 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  27.38 
 
 
409 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0986  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.33 
 
 
334 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.38 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1699  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.79 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2015  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.25 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2519  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.99 
 
 
323 aa  60.1  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2650  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.05 
 
 
325 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0373  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.91 
 
 
324 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1338  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.39 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1348  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.56 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1344  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.56 
 
 
317 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3020  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.66 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75587  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0350  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.56 
 
 
324 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.110992  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1630  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.56 
 
 
324 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2329  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.46 
 
 
326 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1771  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.96 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1374  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.81 
 
 
322 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2054  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.46 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.328205 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0323  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.38 
 
 
322 aa  55.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2940  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.09 
 
 
329 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3018  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.09 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000304714  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3251  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.09 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0899313  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2686  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.68 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3249  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.09 
 
 
329 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>