272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1084 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  100 
 
 
347 aa  682    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  53.56 
 
 
350 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  51.13 
 
 
370 aa  293  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  49.15 
 
 
378 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  44.13 
 
 
355 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  45.61 
 
 
355 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  40.46 
 
 
354 aa  249  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  40.17 
 
 
394 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  40.86 
 
 
350 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  40.74 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  39.6 
 
 
350 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  44.64 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  43.47 
 
 
369 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  43.66 
 
 
378 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  44.35 
 
 
349 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  37.32 
 
 
354 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  43.1 
 
 
378 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  42.03 
 
 
352 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  37.39 
 
 
349 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  40.74 
 
 
352 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  37.04 
 
 
360 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  36.18 
 
 
353 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36.8 
 
 
357 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36.71 
 
 
350 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.61 
 
 
364 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  36.42 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36.42 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36.75 
 
 
366 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  42.57 
 
 
350 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  38.07 
 
 
357 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.33 
 
 
350 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.85 
 
 
350 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  37.7 
 
 
306 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  37.7 
 
 
306 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  32.92 
 
 
350 aa  186  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  36.18 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.63 
 
 
361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.37 
 
 
350 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  35.67 
 
 
373 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  30.92 
 
 
359 aa  169  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.22 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.73 
 
 
373 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  29.69 
 
 
362 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  29.92 
 
 
362 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  32.19 
 
 
343 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  30.58 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.25 
 
 
377 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.65 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  31.09 
 
 
357 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.15 
 
 
373 aa  126  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.37 
 
 
393 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  27.9 
 
 
362 aa  126  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.33 
 
 
368 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  31 
 
 
382 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.98 
 
 
363 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  36.1 
 
 
364 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  30.4 
 
 
349 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  35.86 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  29.81 
 
 
360 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  28.96 
 
 
656 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  27.48 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  29.7 
 
 
404 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.73 
 
 
365 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  31.35 
 
 
396 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.68 
 
 
344 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.48 
 
 
344 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  29.81 
 
 
399 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.37 
 
 
368 aa  99.4  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  30.14 
 
 
361 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.85 
 
 
354 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  27.61 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  31.54 
 
 
351 aa  94  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.84 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.35 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1989  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  28.96 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6810  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.33 
 
 
336 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  24.55 
 
 
406 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.47 
 
 
320 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0762403  normal  0.118636 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  23.66 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3017  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.3 
 
 
348 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1640  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.76 
 
 
329 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.121546  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0986  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.3 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1806  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.17 
 
 
323 aa  59.7  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.278367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2003  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.64 
 
 
321 aa  59.3  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02910  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.55 
 
 
316 aa  59.3  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10280  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.17 
 
 
328 aa  59.3  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.057414 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1530  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.09 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1326  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.54 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1699  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.85 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1817  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.42 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.442816  hitchhiker  0.00257504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1050  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.682522  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  26.09 
 
 
406 aa  56.6  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002994  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASIII  21.82 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000798745  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0229  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  20.39 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1726  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.04 
 
 
331 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000259037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2370  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.91 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.196696  normal  0.0307335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2193  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23 
 
 
356 aa  55.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2912  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.97 
 
 
329 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462456  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1609  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.59 
 
 
316 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.25 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00187738  normal  0.904573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>