94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2809 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  100 
 
 
413 aa  821    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  63.49 
 
 
382 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  62.53 
 
 
404 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  59.74 
 
 
399 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  57.58 
 
 
396 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  38.69 
 
 
656 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  38.46 
 
 
362 aa  236  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.97 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.84 
 
 
404 aa  229  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  40.37 
 
 
357 aa  226  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  35.7 
 
 
362 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  33.52 
 
 
362 aa  219  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  39.21 
 
 
360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  40.31 
 
 
363 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  40.26 
 
 
364 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  41.08 
 
 
376 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  36.76 
 
 
343 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36.74 
 
 
368 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  38.44 
 
 
344 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  32.98 
 
 
350 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  35.95 
 
 
351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  35.47 
 
 
393 aa  153  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.65 
 
 
350 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  35.17 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.22 
 
 
350 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  32.4 
 
 
350 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  32.4 
 
 
350 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  32.12 
 
 
350 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.66 
 
 
350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36.24 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  35.09 
 
 
355 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  32.06 
 
 
354 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.75 
 
 
361 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.43 
 
 
377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  27.88 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  33.58 
 
 
361 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.83 
 
 
350 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.63 
 
 
350 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  36.6 
 
 
378 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  36 
 
 
349 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.81 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  37.4 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  29.12 
 
 
350 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  35.85 
 
 
378 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.1 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.37 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  30.46 
 
 
353 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.51 
 
 
366 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  31.94 
 
 
349 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  30.79 
 
 
406 aa  123  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.76 
 
 
364 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  27.84 
 
 
394 aa  122  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  32.95 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.91 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  33.91 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  32 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.25 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.93 
 
 
352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.27 
 
 
354 aa  116  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.37 
 
 
357 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  29.95 
 
 
366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.24 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  33.24 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.1 
 
 
363 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  34.63 
 
 
350 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  30.49 
 
 
353 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.19 
 
 
365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.72 
 
 
344 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  27.95 
 
 
354 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.06 
 
 
373 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  33.73 
 
 
378 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.37 
 
 
349 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.92 
 
 
357 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  25.86 
 
 
406 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  31.77 
 
 
373 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  32.28 
 
 
347 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.62 
 
 
359 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  25.14 
 
 
406 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1099  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  22.14 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.72 
 
 
330 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  27.02 
 
 
330 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000247729  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26714  beta ketoacyl-coa synthase  29.89 
 
 
545 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0068  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.97 
 
 
329 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1100  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.96 
 
 
332 aa  51.6  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1613  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.62 
 
 
328 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3101  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.57 
 
 
330 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2370  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.16 
 
 
318 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.196696  normal  0.0307335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5065  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.28 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1771  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.67 
 
 
332 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1974  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.24 
 
 
317 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568575  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1455  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.61 
 
 
335 aa  43.9  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346533  normal  0.0465757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3379  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.52 
 
 
314 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1640  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.91 
 
 
329 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.121546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1326  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.53 
 
 
325 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>