81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1186 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  100 
 
 		 376 aa  741    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  49.14 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  47.99 
 
 		 360 aa  305  6e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  40.86 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  39.33 
 
 		 363 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  43.6 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  34.35 
 
 		 656 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  38.61 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  39.84 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  36 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  35.91 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  34.9 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  37.23 
 
 		 404 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  32.33 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  39.54 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  35.04 
 
 		 373 aa  176  5e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  37.27 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  36.97 
 
 		 343 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  34.03 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  33.93 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.1 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  40.07 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  32.22 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  34.26 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  34.05 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  35.34 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  29.34 
 
 		 350 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  35.34 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  35.13 
 
 		 355 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.43 
 
 		 350 aa  119  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  25.34 
 
 		 359 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  36.86 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.56 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  35.9 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  27.57 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  32.03 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  35.29 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.14 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.89 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  28.53 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.29 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.48 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  24.32 
 
 		 350 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.87 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.65 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.22 
 
 		 350 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.06 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  31.09 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.38 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.32 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.54 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.29 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.75 
 
 		 344 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.28 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  30.28 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.56 
 
 		 350 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  30.8 
 
 		 306 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.8 
 
 		 306 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.49 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  30.57 
 
 		 409 aa  97.1  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  29.37 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  32.94 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  30.15 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.89 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.69 
 
 		 364 aa  92.8  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.73 
 
 		 357 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  27.99 
 
 		 406 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.33 
 
 		 354 aa  90.1  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  30 
 
 		 349 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.6 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.98 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  31.99 
 
 		 350 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  28.85 
 
 		 354 aa  86.7  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  29.5 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  27.18 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  30.6 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  30.17 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.59 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26714  beta ketoacyl-coa synthase  32.91 
 
 		 545 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0666  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.29 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.52577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  29.46 
 
 		 330 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000247729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>