98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3897 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  100 
 
 
406 aa  847    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  91.87 
 
 
406 aa  785    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  63.24 
 
 
406 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  60.78 
 
 
409 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1099  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  33.25 
 
 
417 aa  252  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  33.33 
 
 
396 aa  125  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.47 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  28.82 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  31.91 
 
 
364 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.69 
 
 
344 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  29.02 
 
 
363 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  27.84 
 
 
357 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  31.91 
 
 
656 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.93 
 
 
404 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.24 
 
 
368 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  30.83 
 
 
399 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  29.37 
 
 
404 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.34 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  30.29 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  29.9 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  26.67 
 
 
413 aa  96.7  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.19 
 
 
350 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.5 
 
 
355 aa  89.7  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  26.32 
 
 
350 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  26.32 
 
 
350 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  29.77 
 
 
362 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  25.44 
 
 
351 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  26.32 
 
 
350 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  27.31 
 
 
357 aa  87  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.38 
 
 
349 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.95 
 
 
359 aa  86.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  29.26 
 
 
360 aa  84.7  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.32 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  28.68 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  26.37 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  27 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  24 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  23.99 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30 
 
 
368 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  23.91 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  25 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.89 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.43 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  27.12 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.14 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  26.7 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  28.72 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  25.37 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.24 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.37 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  23.89 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.07 
 
 
354 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  24.63 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  24.32 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.26 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  22.12 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  25.09 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.85 
 
 
355 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  26.34 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  26.34 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  27.13 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.07 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  23.44 
 
 
350 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  21.73 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  21.73 
 
 
349 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.12 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.84 
 
 
393 aa  63.5  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  23.66 
 
 
350 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  25 
 
 
393 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  25.74 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  27.01 
 
 
354 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.89 
 
 
378 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.26 
 
 
378 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  25.26 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  25 
 
 
347 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  26.63 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  21.84 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0023  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.19 
 
 
324 aa  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0986  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.87 
 
 
334 aa  50.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0941  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.42 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000834729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1699  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.52 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1974  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  30.08 
 
 
317 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2370  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  34.94 
 
 
318 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.196696  normal  0.0307335 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0237  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.65 
 
 
328 aa  47  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.524505  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3379  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.75 
 
 
314 aa  47  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3621  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  36.25 
 
 
314 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000741392 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00675  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) synthase  22.71 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7055  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase III  30.69 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1669  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  21.12 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  22.12 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1771  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  31.37 
 
 
332 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0602  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  20.75 
 
 
311 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2075  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  34.21 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000317439  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0372  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  32.12 
 
 
328 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01501  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.07 
 
 
310 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.626992  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3511  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  37.18 
 
 
322 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4161  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  31.65 
 
 
339 aa  42.7  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.473826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>