More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1868 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  100 
 
 
349 aa  690    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  99.71 
 
 
349 aa  687    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  62 
 
 
350 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  58.29 
 
 
350 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  56.29 
 
 
350 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  63.56 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  56 
 
 
394 aa  391  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  43.48 
 
 
347 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  36.68 
 
 
354 aa  209  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  44.07 
 
 
378 aa  208  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  42.03 
 
 
350 aa  207  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  34.68 
 
 
349 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  32.95 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  39.32 
 
 
355 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  41.19 
 
 
370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  35.57 
 
 
360 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36.29 
 
 
350 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  39.72 
 
 
350 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  36 
 
 
350 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  36 
 
 
350 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  35.57 
 
 
366 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  37.5 
 
 
373 aa  189  4e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  36 
 
 
352 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  35.61 
 
 
357 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.48 
 
 
364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  30.46 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  29.6 
 
 
350 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  34.86 
 
 
355 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.68 
 
 
350 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  33.99 
 
 
353 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.99 
 
 
361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.19 
 
 
350 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  35.02 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  35.02 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.17 
 
 
357 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  33.43 
 
 
353 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  37.24 
 
 
378 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  36.49 
 
 
369 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  36.41 
 
 
378 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.87 
 
 
350 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  30.57 
 
 
362 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  31.14 
 
 
362 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  31.36 
 
 
363 aa  151  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.08 
 
 
373 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.58 
 
 
365 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.64 
 
 
368 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.17 
 
 
373 aa  136  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  30.42 
 
 
382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  31.95 
 
 
343 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.08 
 
 
404 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  32.14 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  35.48 
 
 
359 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.63 
 
 
368 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.68 
 
 
363 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.23 
 
 
349 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.75 
 
 
344 aa  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  31.09 
 
 
364 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.81 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  28.72 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  25.21 
 
 
362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  30.35 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  30.05 
 
 
360 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  31.01 
 
 
396 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  32.72 
 
 
351 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  29.54 
 
 
399 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.06 
 
 
344 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  29.72 
 
 
366 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  30.15 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.56 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  28.41 
 
 
393 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  33.33 
 
 
349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  25.13 
 
 
656 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.03 
 
 
361 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  21.49 
 
 
406 aa  90.1  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  28.65 
 
 
376 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  26.9 
 
 
406 aa  86.7  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  21.23 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2633  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.42 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3280  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.42 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0636  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.42 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0643403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  25.48 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5272  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.45 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26714  beta ketoacyl-coa synthase  24.61 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2193  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.1 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1853  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  28.12 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0068  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.05 
 
 
329 aa  66.2  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1730  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.86 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1989  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  27.7 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6224  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.57 
 
 
330 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379865  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1183  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  25.56 
 
 
325 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1645  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  25.99 
 
 
346 aa  62.8  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0863125  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1492  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.21 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.560119  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1583  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.32 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0414109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1523  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.96 
 
 
326 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00187738  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0368  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.43 
 
 
333 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.772942  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2015  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.57 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0611  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.51 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1699  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  24.83 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0638  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.72 
 
 
324 aa  60.8  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1389  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.21 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>