82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18741 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  100 
 
 
364 aa  740    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  60.83 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  45.7 
 
 
373 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  37.4 
 
 
362 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  36.46 
 
 
362 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  37.89 
 
 
382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  37.85 
 
 
357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  39.12 
 
 
360 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  35.07 
 
 
656 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  42.66 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  38.42 
 
 
396 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.87 
 
 
404 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  38.66 
 
 
399 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  41.75 
 
 
404 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  33.33 
 
 
362 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  32.42 
 
 
393 aa  186  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  37.78 
 
 
376 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  36.77 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  35.2 
 
 
368 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  34.55 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  36.86 
 
 
343 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.79 
 
 
393 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  30.84 
 
 
394 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  37.98 
 
 
368 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  38.33 
 
 
349 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.22 
 
 
354 aa  146  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.85 
 
 
350 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  28.46 
 
 
361 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  38.38 
 
 
378 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.39 
 
 
350 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  37.55 
 
 
369 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.18 
 
 
350 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  31.5 
 
 
350 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  34.43 
 
 
354 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  38.52 
 
 
378 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  29.57 
 
 
350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.57 
 
 
350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  31.61 
 
 
353 aa  135  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  34.92 
 
 
355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  29.04 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  34.29 
 
 
352 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  33.33 
 
 
355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.35 
 
 
360 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  28.82 
 
 
359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.85 
 
 
357 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  32.29 
 
 
350 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  31.58 
 
 
364 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  40.23 
 
 
359 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  36.69 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.27 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  27 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.13 
 
 
363 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  36.02 
 
 
350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  32.13 
 
 
366 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  32.13 
 
 
306 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  32.13 
 
 
306 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.82 
 
 
349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  28.63 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.07 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.94 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  32.08 
 
 
370 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  28.11 
 
 
361 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  25 
 
 
377 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.72 
 
 
406 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  31.13 
 
 
357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  34.09 
 
 
349 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.77 
 
 
406 aa  109  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  29.46 
 
 
373 aa  109  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  29.93 
 
 
353 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  30.26 
 
 
406 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  33.71 
 
 
349 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.45 
 
 
373 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1084  chalcone and stilbene synthases-like protein  35.38 
 
 
347 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  31.1 
 
 
409 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  27.6 
 
 
366 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3635  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.11 
 
 
344 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.36 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  24.31 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1099  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  21.49 
 
 
417 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26714  beta ketoacyl-coa synthase  19.2 
 
 
545 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0023  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.07 
 
 
324 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3368  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.48 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>