35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1099 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1099  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  100 
 
 
417 aa  870    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  33.25 
 
 
406 aa  252  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  32.77 
 
 
406 aa  252  7e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  31.5 
 
 
409 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  29.93 
 
 
406 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  22.42 
 
 
382 aa  73.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  22.14 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  21.28 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  21.27 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  23.94 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.32 
 
 
361 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  22.3 
 
 
357 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  22.06 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  21.49 
 
 
364 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  21.69 
 
 
396 aa  60.1  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  22.62 
 
 
656 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  23.1 
 
 
362 aa  57  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  21.68 
 
 
373 aa  56.6  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  22.55 
 
 
352 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  21.43 
 
 
363 aa  53.1  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3249  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.1 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3018  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.1 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000304714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3003  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.1 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0164422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3251  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.1 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0899313  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2940  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  28.1 
 
 
329 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00496148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2959  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  27.27 
 
 
329 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00328418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  21.09 
 
 
365 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  23.05 
 
 
350 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3621  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  29.49 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000741392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1177  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.21 
 
 
330 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  normal  0.0343883 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  22.68 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  22.68 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  21.21 
 
 
361 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  20.45 
 
 
355 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  23.63 
 
 
320 aa  43.5  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0762403  normal  0.118636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>