83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29530 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_29530  Type III polyketide synthase  100 
 
 		 409 aa  848    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29550  Type III polyketide synthase  71.32 
 
 		 406 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3899  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  61.27 
 
 		 406 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.824254  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3897  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  60.78 
 
 		 406 aa  525  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1099  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  31.5 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0466  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.35 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2809  Naringenin-chalcone synthase  32.95 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4821  chalcone and stilbene synthase domain protein  34.66 
 
 		 344 aa  116  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18900  predicted naringenin-chalcone synthase  32.78 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0312297  normal  0.351534 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04550  predicted naringenin-chalcone synthase  32.23 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1339  naringenin-chalcone synthase  31.89 
 
 		 363 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.538359  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4712  naringenin-chalcone synthase  28.34 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1939  Naringenin-chalcone synthase  30.9 
 
 		 399 aa  99.8  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000153142 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18741  chalcone synthase (CHS)  31.1 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.406295 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2532  chalcone and stilbene synthase domain protein  29.04 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4396  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  27.76 
 
 		 368 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0256  naringenin-chalcone synthase  31.68 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.524336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3391  Naringenin-chalcone synthase  33.98 
 
 		 360 aa  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20410  predicted naringenin-chalcone synthase  29.25 
 
 		 351 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.194613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2198  naringenin-chalcone synthase  29.18 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.109224  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4694  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  30.92 
 
 		 349 aa  90.5  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.831372  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4264  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.65 
 
 		 368 aa  87  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.188151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2104  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.2 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2037  Naringenin-chalcone synthase  27.02 
 
 		 656 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629301  normal  0.879643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1196  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  27 
 
 		 357 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3794  naringenin-chalcone synthase  31.72 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5115  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.38 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0421  chalcone synthase  29.28 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0145  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  29.06 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0021  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  29.18 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1186  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.06 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.857577  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5033  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.17 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.952361  normal  0.260327 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3232  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.05 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2112  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.28 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.454766  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10908  naringenin-chalcone synthase  26.42 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.559133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1086  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.56 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0962351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1059  chalcone and stilbene synthases-like protein  30.56 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1075  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  30.56 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0430  chalcone and stilbene synthase domain protein  24.5 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1642  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.89 
 
 		 350 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00774069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5140  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  26.14 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.734202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1028  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  24.56 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3187  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.52 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.397507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4977  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.15 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.110388  normal  0.0854213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5949  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.16 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.207884  normal  0.0327105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2390  chalcone and stilbene synthase domain protein  24.75 
 
 		 355 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2328  chalcone and stilbene synthases-like protein  23.15 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.579896  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0398  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.8 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2375  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  23.15 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3105  chalcone and stilbene synthases-like  28.14 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2367  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  22.82 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980596  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1740  chalcone and stilbene synthase domain protein  26.95 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3991  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  29.25 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222559  normal  0.414224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11401  hypothetical protein  23.48 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3808  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  24.92 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1903  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  26.87 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000467282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2326  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.65 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.190568  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11678  chalcone synthase pks10  24.44 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2676  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  27.57 
 
 		 354 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11683  chalcone synthase pks11  26.86 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.133328  normal  0.163848 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4105  chalcone and stilbene synthases-like  24.43 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0202  putative Type III polyketide synthase  25.19 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2458  chalcone and stilbene synthases-like  25.57 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1868  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  25.48 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1160  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.38 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.640364  hitchhiker  0.0041842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0226  naringenin-chalcone synthase  25.48 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1888  chalcone and stilbene synthase domain protein  25.37 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.361608  normal  0.338174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00500  predicted naringenin-chalcone synthase  25 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.281948  normal  0.904387 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2602  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.93 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2733  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  30.86 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4185  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.76 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0192422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1949  chalcone and stilbene synthase domain-containing protein  27.38 
 
 		 350 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0416  chalcone and stilbene synthase domain protein  27.41 
 
 		 378 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0415  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  26.62 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0387  chalcone/stilbene synthase-like  27.74 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.363189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7055  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase III  25.57 
 
 		 318 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5652  chalcone/stilbene synthase domain-containing protein  24.62 
 
 		 352 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3706  Beta-ketoacyl-acyl-carrier-protein synthase I  33.67 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.389353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1684  chalcone and stilbene synthases-like protein  26.01 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.436758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  36.46 
 
 		 333 aa  47.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0510384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3511  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  40.43 
 
 		 322 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2370  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  35.48 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.196696  normal  0.0307335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3379  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  33.75 
 
 		 314 aa  43.1  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>