More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11500  Dihydropteroate synthase  100 
 
 		 288 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  66.19 
 
 		 293 aa  363  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0777  dihydropteroate synthase  72.86 
 
 		 286 aa  352  5.9999999999999994e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1314  dihydropteroate synthase  61.97 
 
 		 286 aa  349  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1839  dihydropteroate synthase  64.81 
 
 		 287 aa  338  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0851002  normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0649  dihydropteroate synthase  65.19 
 
 		 289 aa  338  7e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163366  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1234  dihydropteroate synthase  60.92 
 
 		 286 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0702  dihydropteroate synthase  65.19 
 
 		 289 aa  335  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0295  dihydropteroate synthase  64.94 
 
 		 291 aa  334  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7946  dihydropteroate synthase  61.09 
 
 		 312 aa  331  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1164  dihydropteroate synthase  65.36 
 
 		 287 aa  328  5.0000000000000004e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4509  dihydropteroate synthase  65.47 
 
 		 282 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4236  dihydropteroate synthase  62.89 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3417  Dihydropteroate synthase  61.59 
 
 		 277 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4006  dihydropteroate synthase  62.54 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4080  dihydropteroate synthase  62.54 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3839  dihydropteroate synthase  62.08 
 
 		 270 aa  318  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2186  dihydropteroate synthase  64.44 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.813106 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2621  dihydropteroate synthase  64.29 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000495389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4156  dihydropteroate synthase  58.3 
 
 		 287 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000130669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3311  dihydropteroate synthase  63.57 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0877  dihydropteroate synthase  59.34 
 
 		 319 aa  294  9e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11231  dihydropteroate synthase 2 folP2  62.68 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.722416  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1874  dihydropteroate synthase  58.46 
 
 		 294 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.214631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25940  Dihydropteroate synthase  56.57 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0807  dihydropteroate synthase  53.33 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.653444 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1001  dihydropteroate synthase  54.92 
 
 		 308 aa  265  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0978  dihydropteroate synthase  56.89 
 
 		 323 aa  252  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.891632  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26890  Dihydropteroate synthase  45.69 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.483029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  41.06 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1304  dihydropteroate synthase  47.64 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.376163  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  34.77 
 
 		 400 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  35.64 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  37.97 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  38.83 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  36.33 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  35.96 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  38.04 
 
 		 394 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  35.84 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  39.16 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  37.59 
 
 		 399 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  37.59 
 
 		 278 aa  169  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  33.21 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  33.45 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  36.5 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  38.02 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  34.56 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  36.3 
 
 		 284 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  38.02 
 
 		 277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  39.78 
 
 		 289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  39.39 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  37.65 
 
 		 277 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  35.14 
 
 		 258 aa  165  9e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  34.89 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14860  Dihydropteroate synthase  40 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.847859  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  36.88 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  40.46 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  34.42 
 
 		 277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  35.14 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  33.45 
 
 		 356 aa  163  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  34.42 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  38.31 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  36.21 
 
 		 302 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  34.78 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  34.53 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  34.53 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  36.74 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  35.42 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  35.42 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  35.42 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  35.42 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  35.42 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  35.42 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  35.42 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  35.42 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  34.93 
 
 		 394 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  35.53 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  35.94 
 
 		 282 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  35.94 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  35.06 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  35.94 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  37.26 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  36.23 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  35.94 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  34.78 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  34.78 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  34.78 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  34.78 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  34.78 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  34.78 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  34.42 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  41.39 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  34.42 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  36.26 
 
 		 396 aa  159  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  36.59 
 
 		 283 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  36.05 
 
 		 277 aa  158  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>