More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0295 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0295  dihydropteroate synthase  100 
 
 
291 aa  560  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1314  dihydropteroate synthase  67.48 
 
 
286 aa  391  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0649  dihydropteroate synthase  70.53 
 
 
289 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163366  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3839  dihydropteroate synthase  72.96 
 
 
270 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0265276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0702  dihydropteroate synthase  70.18 
 
 
289 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0877  dihydropteroate synthase  70.8 
 
 
319 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1839  dihydropteroate synthase  65.49 
 
 
287 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0851002  normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7946  dihydropteroate synthase  65.03 
 
 
312 aa  364  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1234  dihydropteroate synthase  65.96 
 
 
286 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4156  dihydropteroate synthase  64.08 
 
 
287 aa  348  8e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000130669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3417  Dihydropteroate synthase  64.6 
 
 
277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2621  dihydropteroate synthase  67.53 
 
 
290 aa  330  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000495389  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11500  Dihydropteroate synthase  64.94 
 
 
288 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  62.22 
 
 
293 aa  318  6e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4236  dihydropteroate synthase  62.32 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1874  dihydropteroate synthase  60.55 
 
 
294 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.214631  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4509  dihydropteroate synthase  62.32 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4006  dihydropteroate synthase  61.96 
 
 
291 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4080  dihydropteroate synthase  61.96 
 
 
291 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708495  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1164  dihydropteroate synthase  61.51 
 
 
287 aa  304  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2186  dihydropteroate synthase  63.04 
 
 
291 aa  300  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.813106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0777  dihydropteroate synthase  63.29 
 
 
286 aa  295  8e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3311  dihydropteroate synthase  64.71 
 
 
293 aa  292  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11231  dihydropteroate synthase 2 folP2  62.32 
 
 
318 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.722416  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25940  Dihydropteroate synthase  56.18 
 
 
317 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1001  dihydropteroate synthase  57.14 
 
 
308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0978  dihydropteroate synthase  57.09 
 
 
323 aa  252  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.891632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0807  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 
288 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.653444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26890  Dihydropteroate synthase  45.26 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.483029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 
400 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14860  Dihydropteroate synthase  47.52 
 
 
329 aa  192  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.847859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  40.46 
 
 
283 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  48.25 
 
 
283 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  38.93 
 
 
285 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  45.91 
 
 
283 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  41.09 
 
 
394 aa  185  9e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  46.3 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  38.7 
 
 
393 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  40.15 
 
 
399 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  38.89 
 
 
278 aa  178  9e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  40.15 
 
 
282 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  39.86 
 
 
277 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  38.52 
 
 
278 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  36.59 
 
 
277 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  39.69 
 
 
286 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  42.24 
 
 
311 aa  175  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  39.5 
 
 
277 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  37.65 
 
 
270 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  39.5 
 
 
277 aa  175  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  39.42 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  39.5 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  36.59 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  36.59 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  36.59 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.59 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.59 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  40.78 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  36.59 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  36.96 
 
 
277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  40.31 
 
 
279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  38.46 
 
 
394 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  36.23 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
397 aa  172  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  36.23 
 
 
286 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  39.15 
 
 
277 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  35.87 
 
 
277 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  34.48 
 
 
275 aa  169  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  36.05 
 
 
286 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  35.11 
 
 
376 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  40.68 
 
 
436 aa  167  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  35.55 
 
 
269 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  35.55 
 
 
269 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  35.98 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  34.77 
 
 
258 aa  166  4e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  36.88 
 
 
277 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  35.14 
 
 
259 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  41.18 
 
 
290 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  37.31 
 
 
277 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  37.31 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 
277 aa  165  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  36.88 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  34.75 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  36.65 
 
 
287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  38.43 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  36.47 
 
 
276 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
356 aa  163  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  36.68 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  36.68 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  36.06 
 
 
279 aa  162  9e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  36.92 
 
 
280 aa  162  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  42.5 
 
 
294 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  35.77 
 
 
280 aa  161  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 
259 aa  161  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 
810 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1304  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
281 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.376163  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 
278 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 
277 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 
277 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>