More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3839 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3839  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 270 aa  522  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0877  dihydropteroate synthase  86.62 
 
 		 319 aa  437  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1839  dihydropteroate synthase  72.12 
 
 		 287 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0851002  normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0649  dihydropteroate synthase  72.59 
 
 		 289 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163366  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0702  dihydropteroate synthase  72.22 
 
 		 289 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0295  dihydropteroate synthase  72.96 
 
 		 291 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7946  dihydropteroate synthase  69.74 
 
 		 312 aa  359  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1314  dihydropteroate synthase  68.89 
 
 		 286 aa  358  6e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3417  Dihydropteroate synthase  69.77 
 
 		 277 aa  347  9e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2621  dihydropteroate synthase  71.8 
 
 		 290 aa  330  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000495389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1234  dihydropteroate synthase  66.54 
 
 		 286 aa  328  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4156  dihydropteroate synthase  62.45 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000130669  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  61.34 
 
 		 293 aa  311  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11500  Dihydropteroate synthase  62.08 
 
 		 288 aa  305  4.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1874  dihydropteroate synthase  64.64 
 
 		 294 aa  299  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.214631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0777  dihydropteroate synthase  64.94 
 
 		 286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1164  dihydropteroate synthase  58.52 
 
 		 287 aa  278  8e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4509  dihydropteroate synthase  59.12 
 
 		 282 aa  276  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4236  dihydropteroate synthase  57.66 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4006  dihydropteroate synthase  57.3 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4080  dihydropteroate synthase  57.3 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2186  dihydropteroate synthase  58.39 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.813106 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0807  dihydropteroate synthase  51.8 
 
 		 288 aa  255  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.653444 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1001  dihydropteroate synthase  57.91 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3311  dihydropteroate synthase  57.78 
 
 		 293 aa  248  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11231  dihydropteroate synthase 2 folP2  56.93 
 
 		 318 aa  241  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.722416  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25940  Dihydropteroate synthase  53.9 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0978  dihydropteroate synthase  55.36 
 
 		 323 aa  232  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.891632  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26890  Dihydropteroate synthase  44.02 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.483029  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14860  Dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 329 aa  169  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.847859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  39.92 
 
 		 285 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  36.43 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  37.31 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  37.31 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  37.31 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  37.31 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  37.31 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1304  dihydropteroate synthase  46.48 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.376163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  38.08 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  36.92 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  34.57 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  35.88 
 
 		 400 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  39.41 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  37.45 
 
 		 397 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  40.61 
 
 		 394 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  40.3 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  39.15 
 
 		 402 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  39.15 
 
 		 394 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  43.62 
 
 		 283 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  38.37 
 
 		 400 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  41.73 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  42.39 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  37.93 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  38 
 
 		 287 aa  148  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  37.5 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  39.06 
 
 		 282 aa  148  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  37.97 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  37.11 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  39.38 
 
 		 282 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  35.66 
 
 		 269 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  42.39 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  38.28 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  38.28 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  37.89 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  35.66 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  38.28 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  36.43 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  37.16 
 
 		 278 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  39.62 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  37.36 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  35.45 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  37.89 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  32.3 
 
 		 397 aa  144  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  36.82 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  37.45 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  37.11 
 
 		 279 aa  143  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  39.52 
 
 		 436 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  37.74 
 
 		 396 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  36.05 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  36.05 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  34.23 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  36.05 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  36.02 
 
 		 399 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  37.11 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>