More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0777 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0777  dihydropteroate synthase  100 
 
 
286 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11500  Dihydropteroate synthase  72.86 
 
 
288 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  68.93 
 
 
293 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1234  dihydropteroate synthase  65.96 
 
 
286 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1839  dihydropteroate synthase  66.32 
 
 
287 aa  352  4e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0851002  normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1314  dihydropteroate synthase  63.29 
 
 
286 aa  351  8.999999999999999e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1164  dihydropteroate synthase  69.75 
 
 
287 aa  346  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7946  dihydropteroate synthase  62.37 
 
 
312 aa  340  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0295  dihydropteroate synthase  63.29 
 
 
291 aa  329  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0649  dihydropteroate synthase  62.94 
 
 
289 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163366  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3839  dihydropteroate synthase  64.94 
 
 
270 aa  319  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0265276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4156  dihydropteroate synthase  59.3 
 
 
287 aa  318  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000130669  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3311  dihydropteroate synthase  67.62 
 
 
293 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0702  dihydropteroate synthase  61.89 
 
 
289 aa  317  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4509  dihydropteroate synthase  63.57 
 
 
282 aa  316  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4236  dihydropteroate synthase  62.15 
 
 
291 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4006  dihydropteroate synthase  61.81 
 
 
291 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4080  dihydropteroate synthase  61.81 
 
 
291 aa  315  8e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708495  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2621  dihydropteroate synthase  65.93 
 
 
290 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000495389  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2186  dihydropteroate synthase  63.19 
 
 
291 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.813106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0877  dihydropteroate synthase  62.77 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3417  Dihydropteroate synthase  58.67 
 
 
277 aa  295  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11231  dihydropteroate synthase 2 folP2  62.11 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.722416  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1874  dihydropteroate synthase  58.87 
 
 
294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.214631  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25940  Dihydropteroate synthase  58.36 
 
 
317 aa  277  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1001  dihydropteroate synthase  57.82 
 
 
308 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0978  dihydropteroate synthase  58.95 
 
 
323 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.891632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0807  dihydropteroate synthase  52.61 
 
 
288 aa  262  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.653444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26890  Dihydropteroate synthase  45.22 
 
 
325 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.483029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  39.34 
 
 
400 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1304  dihydropteroate synthase  46.97 
 
 
281 aa  171  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.376163  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  37.12 
 
 
285 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  37.73 
 
 
280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  40.81 
 
 
311 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  34.91 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  38.06 
 
 
277 aa  161  9e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
283 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 
294 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  34.6 
 
 
275 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  38.91 
 
 
287 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  37.4 
 
 
394 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  43.19 
 
 
283 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  38.06 
 
 
277 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  38.06 
 
 
277 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  37.31 
 
 
277 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  38.06 
 
 
277 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  36.72 
 
 
394 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  37.31 
 
 
277 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  35.87 
 
 
279 aa  158  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 
286 aa  158  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  32.56 
 
 
258 aa  158  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 
280 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  37.31 
 
 
284 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14860  Dihydropteroate synthase  41.36 
 
 
329 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.847859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  32.97 
 
 
270 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  34.2 
 
 
400 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  36.06 
 
 
279 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  31.46 
 
 
266 aa  157  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  34.75 
 
 
259 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  38.24 
 
 
282 aa  156  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  36.33 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  36.33 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  34.36 
 
 
259 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  37.88 
 
 
289 aa  155  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  36.03 
 
 
277 aa  155  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  38.24 
 
 
284 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  34.2 
 
 
276 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  34.98 
 
 
412 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  41.25 
 
 
283 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  36.94 
 
 
277 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  41.63 
 
 
283 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
277 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  34.06 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  42.01 
 
 
284 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09051  putative dihydropteroate synthase  31.27 
 
 
280 aa  152  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249023  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  36.25 
 
 
399 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  35.82 
 
 
282 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  37.6 
 
 
402 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 
396 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
301 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  35.34 
 
 
278 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  34.38 
 
 
393 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
277 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 
286 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 
347 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  34.07 
 
 
275 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  33.71 
 
 
269 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
277 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  37.13 
 
 
282 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
280 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
280 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  33.46 
 
 
280 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  33.46 
 
 
280 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
280 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  33.83 
 
 
277 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  36.3 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  33.71 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  33.08 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>