More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3311 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3311  dihydropteroate synthase  100 
 
 
293 aa  573  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4236  dihydropteroate synthase  70.49 
 
 
291 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4006  dihydropteroate synthase  70.14 
 
 
291 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4080  dihydropteroate synthase  70.14 
 
 
291 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708495  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4509  dihydropteroate synthase  71.28 
 
 
282 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1164  dihydropteroate synthase  70.77 
 
 
287 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2186  dihydropteroate synthase  70.45 
 
 
291 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.813106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11231  dihydropteroate synthase 2 folP2  70.14 
 
 
318 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.722416  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11500  Dihydropteroate synthase  63.57 
 
 
288 aa  338  8e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  63.48 
 
 
293 aa  338  9e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1314  dihydropteroate synthase  58.3 
 
 
286 aa  333  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7946  dihydropteroate synthase  59.78 
 
 
312 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0295  dihydropteroate synthase  64.71 
 
 
291 aa  328  8e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0649  dihydropteroate synthase  63.1 
 
 
289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163366  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0702  dihydropteroate synthase  63.47 
 
 
289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4156  dihydropteroate synthase  60.85 
 
 
287 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000130669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0777  dihydropteroate synthase  67.62 
 
 
286 aa  317  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1234  dihydropteroate synthase  58.51 
 
 
286 aa  315  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1839  dihydropteroate synthase  58.89 
 
 
287 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0851002  normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3839  dihydropteroate synthase  57.78 
 
 
270 aa  288  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0265276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3417  Dihydropteroate synthase  55.19 
 
 
277 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2621  dihydropteroate synthase  57.04 
 
 
290 aa  278  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000495389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0877  dihydropteroate synthase  53.51 
 
 
319 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1874  dihydropteroate synthase  55.91 
 
 
294 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.214631  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0807  dihydropteroate synthase  52.28 
 
 
288 aa  262  4.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.653444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25940  Dihydropteroate synthase  54.73 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1001  dihydropteroate synthase  53.67 
 
 
308 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0978  dihydropteroate synthase  56.34 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.891632  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26890  Dihydropteroate synthase  46.89 
 
 
325 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.483029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  40.22 
 
 
267 aa  180  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 
294 aa  177  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  40.46 
 
 
394 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  37.6 
 
 
258 aa  177  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1304  dihydropteroate synthase  45.71 
 
 
281 aa  175  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.376163  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  38.1 
 
 
393 aa  175  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  41.06 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  40.22 
 
 
279 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  45.08 
 
 
283 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  37.46 
 
 
400 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  36.86 
 
 
412 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  37.97 
 
 
283 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14860  Dihydropteroate synthase  42.66 
 
 
329 aa  169  7e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.847859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  39.29 
 
 
278 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  44.67 
 
 
283 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  38.93 
 
 
278 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  37.12 
 
 
285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  38.64 
 
 
394 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  34.08 
 
 
266 aa  165  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  39 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  46.31 
 
 
283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  42.07 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  39.54 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  39.41 
 
 
278 aa  163  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  41.37 
 
 
347 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  38.4 
 
 
277 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  38.31 
 
 
278 aa  162  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  39.21 
 
 
289 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  40 
 
 
283 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
280 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
280 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.84 
 
 
280 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.84 
 
 
280 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
277 aa  161  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  38.13 
 
 
277 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
280 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
277 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
277 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  35.5 
 
 
270 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  36.47 
 
 
277 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  38.13 
 
 
277 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  38.17 
 
 
396 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  39.43 
 
 
311 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  35.66 
 
 
275 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  42.25 
 
 
286 aa  159  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  39.39 
 
 
286 aa  159  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 
269 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 
298 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  39 
 
 
280 aa  158  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 
269 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  35.69 
 
 
280 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
397 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  38.24 
 
 
279 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  36.6 
 
 
279 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  35.06 
 
 
286 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
257 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  36.82 
 
 
274 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 
298 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  36.5 
 
 
286 aa  155  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  38.22 
 
 
277 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 
278 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  35.52 
 
 
259 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  36.8 
 
 
277 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  35.52 
 
 
259 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  36.8 
 
 
284 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  36.76 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  39.51 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>