More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1304 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1304  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 281 aa  545  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.376163  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  45.77 
 
 		 277 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  44.07 
 
 		 277 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 		 277 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  46.1 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1839  dihydropteroate synthase  49.03 
 
 		 287 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0851002  normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  44.17 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11500  Dihydropteroate synthase  47.64 
 
 		 288 aa  206  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1234  dihydropteroate synthase  47.43 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26890  Dihydropteroate synthase  45.67 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.483029  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1314  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  38.1 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  40.94 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3417  Dihydropteroate synthase  46.1 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  40.74 
 
 		 277 aa  198  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  44.04 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  41.24 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  40.37 
 
 		 282 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 		 282 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  40.37 
 
 		 282 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 		 282 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 		 282 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 		 282 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 		 282 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 		 282 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  42.05 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  40.48 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  40.74 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0649  dihydropteroate synthase  47.47 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163366  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  38.72 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  40.89 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  39.15 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  38.97 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  39.08 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  40.55 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  39.63 
 
 		 282 aa  188  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  40.23 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  39.71 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0702  dihydropteroate synthase  47.08 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  39.71 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  38.63 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  39.71 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2621  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000495389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  38.97 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4156  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000130669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1874  dihydropteroate synthase  46.89 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.214631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  41.73 
 
 		 400 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  38.97 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 		 435 aa  185  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  42.15 
 
 		 437 aa  185  9e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1001  dihydropteroate synthase  45.64 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  39.13 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4236  dihydropteroate synthase  43.38 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  37.73 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3839  dihydropteroate synthase  46.48 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265276 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  35.82 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0807  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.653444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4006  dihydropteroate synthase  43.01 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4080  dihydropteroate synthase  43.01 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  41.94 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7946  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  44.83 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  38.19 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  35.04 
 
 		 277 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  43.64 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  43.43 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  46.03 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  43.25 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  44.18 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1164  dihydropteroate synthase  45.19 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  40.52 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  40.82 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0295  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  40.89 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  38.85 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  38.13 
 
 		 397 aa  176  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  41.6 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  42.46 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  41.35 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>