More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4006 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4236  dihydropteroate synthase  99.66 
 
 
291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4006  dihydropteroate synthase  100 
 
 
291 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4080  dihydropteroate synthase  100 
 
 
291 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708495  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2186  dihydropteroate synthase  87.97 
 
 
291 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.813106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4509  dihydropteroate synthase  88.3 
 
 
282 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11231  dihydropteroate synthase 2 folP2  81.03 
 
 
318 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.722416  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1164  dihydropteroate synthase  67.46 
 
 
287 aa  354  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3311  dihydropteroate synthase  70.14 
 
 
293 aa  352  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1314  dihydropteroate synthase  59.15 
 
 
286 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  61.97 
 
 
293 aa  335  5e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11500  Dihydropteroate synthase  62.54 
 
 
288 aa  335  5.999999999999999e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1234  dihydropteroate synthase  59.51 
 
 
286 aa  323  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0649  dihydropteroate synthase  63.27 
 
 
289 aa  320  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163366  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0702  dihydropteroate synthase  63.27 
 
 
289 aa  318  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7946  dihydropteroate synthase  58.57 
 
 
312 aa  318  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0295  dihydropteroate synthase  61.96 
 
 
291 aa  317  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1839  dihydropteroate synthase  59.85 
 
 
287 aa  309  4e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0851002  normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4156  dihydropteroate synthase  55.64 
 
 
287 aa  297  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000130669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0777  dihydropteroate synthase  61.81 
 
 
286 aa  295  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3839  dihydropteroate synthase  57.3 
 
 
270 aa  292  5e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0265276 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0807  dihydropteroate synthase  55.44 
 
 
288 aa  285  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.653444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3417  Dihydropteroate synthase  56.27 
 
 
277 aa  278  8e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25940  Dihydropteroate synthase  56.31 
 
 
317 aa  271  6e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2621  dihydropteroate synthase  57.35 
 
 
290 aa  272  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000495389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0877  dihydropteroate synthase  54.92 
 
 
319 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1874  dihydropteroate synthase  58.4 
 
 
294 aa  269  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.214631  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0978  dihydropteroate synthase  57.39 
 
 
323 aa  266  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.891632  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1001  dihydropteroate synthase  55.36 
 
 
308 aa  262  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26890  Dihydropteroate synthase  46.57 
 
 
325 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.483029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  40.68 
 
 
394 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  37.31 
 
 
285 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  38.11 
 
 
270 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  38.97 
 
 
399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  37.41 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  37.28 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  36.94 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  37.99 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  42.74 
 
 
283 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  43.15 
 
 
283 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  38.1 
 
 
393 aa  168  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  40 
 
 
400 aa  168  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
394 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  38.64 
 
 
269 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  38.24 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  38.11 
 
 
277 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  34.32 
 
 
266 aa  166  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  36.67 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  41.33 
 
 
290 aa  165  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  38.64 
 
 
277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  37.77 
 
 
278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  42.06 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  33.46 
 
 
397 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  36.23 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  37.68 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  36.3 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  36.3 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.3 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  36.3 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  38.85 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  37.12 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  36.3 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  36.19 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  38.11 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  36.3 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1304  dihydropteroate synthase  43.01 
 
 
281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.376163  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  35.93 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  35.11 
 
 
258 aa  163  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  37.05 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  36.3 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  37.17 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  37.63 
 
 
299 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14860  Dihydropteroate synthase  41.46 
 
 
329 aa  162  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.847859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  36.5 
 
 
277 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  37.12 
 
 
277 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  36.5 
 
 
277 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  38.46 
 
 
279 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  36.65 
 
 
282 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  42.6 
 
 
294 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 
274 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  39.29 
 
 
311 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  37.36 
 
 
277 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  36.74 
 
 
277 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  36.33 
 
 
396 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  38.26 
 
 
282 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0420  dihydropteroate synthase  37.94 
 
 
291 aa  159  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0615939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 
277 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  41.2 
 
 
286 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  35.74 
 
 
277 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  39.7 
 
 
281 aa  156  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1786  dihydropteroate synthase  38.75 
 
 
286 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  35.66 
 
 
267 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  39.59 
 
 
298 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
400 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  39.84 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  38.55 
 
 
279 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  39.11 
 
 
282 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  39.11 
 
 
282 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  39.11 
 
 
282 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  39.11 
 
 
282 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>