More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1164 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1164  dihydropteroate synthase  100 
 
 
287 aa  562  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4236  dihydropteroate synthase  67.46 
 
 
291 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4006  dihydropteroate synthase  67.46 
 
 
291 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4080  dihydropteroate synthase  67.46 
 
 
291 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708495  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3311  dihydropteroate synthase  70.77 
 
 
293 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2186  dihydropteroate synthase  67.35 
 
 
291 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.813106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4509  dihydropteroate synthase  68.2 
 
 
282 aa  341  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  63.12 
 
 
293 aa  338  8e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11500  Dihydropteroate synthase  65.36 
 
 
288 aa  333  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0777  dihydropteroate synthase  69.75 
 
 
286 aa  325  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0649  dihydropteroate synthase  65.68 
 
 
289 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163366  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0295  dihydropteroate synthase  61.51 
 
 
291 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1314  dihydropteroate synthase  57.6 
 
 
286 aa  319  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1839  dihydropteroate synthase  60.14 
 
 
287 aa  318  7e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0851002  normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0702  dihydropteroate synthase  64.21 
 
 
289 aa  318  7.999999999999999e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11231  dihydropteroate synthase 2 folP2  66.09 
 
 
318 aa  316  3e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.722416  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7946  dihydropteroate synthase  57.25 
 
 
312 aa  311  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1234  dihydropteroate synthase  58.16 
 
 
286 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3839  dihydropteroate synthase  58.52 
 
 
270 aa  298  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0265276 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4156  dihydropteroate synthase  57.2 
 
 
287 aa  297  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000130669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3417  Dihydropteroate synthase  56.83 
 
 
277 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2621  dihydropteroate synthase  58.3 
 
 
290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000495389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0877  dihydropteroate synthase  56.92 
 
 
319 aa  278  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1874  dihydropteroate synthase  56.63 
 
 
294 aa  275  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.214631  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1001  dihydropteroate synthase  57.34 
 
 
308 aa  265  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0807  dihydropteroate synthase  52.63 
 
 
288 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.653444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25940  Dihydropteroate synthase  55.25 
 
 
317 aa  258  9e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0978  dihydropteroate synthase  57.04 
 
 
323 aa  253  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.891632  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26890  Dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
325 aa  203  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.483029  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14860  Dihydropteroate synthase  46.64 
 
 
329 aa  189  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.847859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  41.42 
 
 
400 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  46.1 
 
 
294 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  37.88 
 
 
267 aa  176  5e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  37.59 
 
 
400 aa  176  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  42.28 
 
 
311 aa  175  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  40.53 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  40.08 
 
 
394 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  38.24 
 
 
393 aa  172  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  34.5 
 
 
397 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
280 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
280 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  38.87 
 
 
280 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  38.87 
 
 
280 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
280 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  35.82 
 
 
266 aa  170  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  39.25 
 
 
277 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  39.43 
 
 
283 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
277 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  38.49 
 
 
277 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  37.36 
 
 
277 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0420  dihydropteroate synthase  39.27 
 
 
291 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0615939  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  38.01 
 
 
279 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  38.11 
 
 
286 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  42.28 
 
 
289 aa  167  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  37.96 
 
 
278 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1304  dihydropteroate synthase  45.19 
 
 
281 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.376163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  37.5 
 
 
283 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 
269 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  38.76 
 
 
277 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  35.98 
 
 
285 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  36.53 
 
 
274 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  37.74 
 
 
277 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 
278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  37.26 
 
 
394 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  34.23 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  36.12 
 
 
270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  37.21 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  34.73 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  35.52 
 
 
259 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 
284 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  41.48 
 
 
413 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  40.22 
 
 
278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  37.23 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  38.4 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  34.93 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  38.93 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  35.91 
 
 
259 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  38.02 
 
 
277 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  39.77 
 
 
281 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  38.02 
 
 
277 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  37.64 
 
 
277 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  35.27 
 
 
397 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  39.85 
 
 
278 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  37.64 
 
 
277 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  38.02 
 
 
399 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  38.01 
 
 
283 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  36.98 
 
 
286 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 
376 aa  159  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 
276 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  37.64 
 
 
277 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  37.98 
 
 
277 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
286 aa  157  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09051  putative dihydropteroate synthase  32.7 
 
 
280 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  39.85 
 
 
257 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  34.98 
 
 
275 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  34.88 
 
 
264 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  33.93 
 
 
412 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  38.24 
 
 
283 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  37.11 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>