More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25940 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25940  Dihydropteroate synthase  100 
 
 		 317 aa  614  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0978  dihydropteroate synthase  67.69 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.891632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0807  dihydropteroate synthase  64.21 
 
 		 288 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.653444 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  60.2 
 
 		 293 aa  335  5e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1001  dihydropteroate synthase  65.36 
 
 		 308 aa  335  5e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0649  dihydropteroate synthase  57.67 
 
 		 289 aa  305  7e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163366  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0702  dihydropteroate synthase  56 
 
 		 289 aa  298  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1839  dihydropteroate synthase  56.04 
 
 		 287 aa  298  6e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0851002  normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11500  Dihydropteroate synthase  56.57 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1314  dihydropteroate synthase  52.53 
 
 		 286 aa  293  4e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1234  dihydropteroate synthase  53.02 
 
 		 286 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4006  dihydropteroate synthase  56.31 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4080  dihydropteroate synthase  56.31 
 
 		 291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4236  dihydropteroate synthase  56.31 
 
 		 291 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0295  dihydropteroate synthase  56.18 
 
 		 291 aa  281  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4509  dihydropteroate synthase  57.89 
 
 		 282 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2186  dihydropteroate synthase  57.68 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.813106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7946  dihydropteroate synthase  50.7 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3839  dihydropteroate synthase  53.9 
 
 		 270 aa  267  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0777  dihydropteroate synthase  58.36 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4156  dihydropteroate synthase  49.83 
 
 		 287 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000130669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1164  dihydropteroate synthase  55.25 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3417  Dihydropteroate synthase  50.7 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0877  dihydropteroate synthase  50.5 
 
 		 319 aa  251  9.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11231  dihydropteroate synthase 2 folP2  55.59 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.722416  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2621  dihydropteroate synthase  52.38 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000495389  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3311  dihydropteroate synthase  54.73 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1874  dihydropteroate synthase  48.5 
 
 		 294 aa  225  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.214631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26890  Dihydropteroate synthase  42.45 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.483029  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 		 400 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1304  dihydropteroate synthase  44.6 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.376163  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  34.16 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  40.35 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  34.05 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  36.33 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  39.07 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  33.57 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  37.54 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  35.53 
 
 		 393 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  34.15 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  34.14 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  37.36 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  37.68 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  41.02 
 
 		 283 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  33.94 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  33.94 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  33.94 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  33.44 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  34.07 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  34.88 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  33.94 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  33.94 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  33.94 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  33.94 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  33.94 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  33.94 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  35.07 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  32.87 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  32.87 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  33.94 
 
 		 277 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  36.75 
 
 		 402 aa  148  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  33.7 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  42.6 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  32.87 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  33.82 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  34.88 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  40.35 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  37.01 
 
 		 278 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  33.56 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  33.56 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  33.56 
 
 		 282 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  33.82 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  33.56 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  31.91 
 
 		 276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  37.96 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  41.88 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  35.87 
 
 		 279 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  30.99 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  31.64 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  35.02 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  34.88 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  35.29 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  32.97 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  32.97 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  34.16 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  35.31 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  35.74 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  32.09 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  31.18 
 
 		 286 aa  143  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  37.31 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  35.84 
 
 		 394 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  31.5 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  39.06 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  33.1 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  35.54 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0420  dihydropteroate synthase  36.24 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0615939  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  32.38 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  33.22 
 
 		 282 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>