More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4156 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4156  dihydropteroate synthase  100 
 
 
287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000130669  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1314  dihydropteroate synthase  71.48 
 
 
286 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1234  dihydropteroate synthase  70.42 
 
 
286 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7946  dihydropteroate synthase  62.94 
 
 
312 aa  349  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0295  dihydropteroate synthase  64.08 
 
 
291 aa  347  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0702  dihydropteroate synthase  59.3 
 
 
289 aa  329  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1839  dihydropteroate synthase  58.04 
 
 
287 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0851002  normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0649  dihydropteroate synthase  58.25 
 
 
289 aa  325  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163366  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3839  dihydropteroate synthase  62.45 
 
 
270 aa  325  7e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0265276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  59.57 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0877  dihydropteroate synthase  59.15 
 
 
319 aa  318  9e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11500  Dihydropteroate synthase  58.3 
 
 
288 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3417  Dihydropteroate synthase  59.7 
 
 
277 aa  298  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4509  dihydropteroate synthase  57.82 
 
 
282 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2621  dihydropteroate synthase  60.75 
 
 
290 aa  295  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000495389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0777  dihydropteroate synthase  59.3 
 
 
286 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4236  dihydropteroate synthase  56 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4006  dihydropteroate synthase  55.64 
 
 
291 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4080  dihydropteroate synthase  55.64 
 
 
291 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708495  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1874  dihydropteroate synthase  55.59 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.214631  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1164  dihydropteroate synthase  57.2 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2186  dihydropteroate synthase  56.29 
 
 
291 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.813106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3311  dihydropteroate synthase  60.85 
 
 
293 aa  278  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11231  dihydropteroate synthase 2 folP2  56.73 
 
 
318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.722416  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1001  dihydropteroate synthase  50.17 
 
 
308 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0978  dihydropteroate synthase  51.96 
 
 
323 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.891632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25940  Dihydropteroate synthase  50.52 
 
 
317 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0807  dihydropteroate synthase  48.42 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.653444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26890  Dihydropteroate synthase  45.26 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.483029  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14860  Dihydropteroate synthase  43.68 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.847859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 
285 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  42.47 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 
283 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  42.47 
 
 
283 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  37.59 
 
 
283 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  35.23 
 
 
270 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  40 
 
 
396 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  36.76 
 
 
400 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  38.27 
 
 
277 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  39.34 
 
 
400 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 
277 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1304  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.376163  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  39.21 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 
280 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  37.55 
 
 
280 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  37.55 
 
 
280 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 
280 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 
277 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 
280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  37.18 
 
 
277 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  34.72 
 
 
266 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  36.1 
 
 
277 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  42.97 
 
 
294 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  35.97 
 
 
269 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  35.97 
 
 
269 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  37.18 
 
 
286 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 
277 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  39.63 
 
 
394 aa  159  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  40 
 
 
311 aa  158  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  36.1 
 
 
356 aa  158  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 
280 aa  158  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  38.35 
 
 
436 aa  158  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  36.5 
 
 
393 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  39.13 
 
 
287 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  36.88 
 
 
275 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  37.12 
 
 
394 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  35.94 
 
 
277 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  35.5 
 
 
274 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  36.47 
 
 
277 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  35.63 
 
 
399 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  35.55 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  35.55 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  35.34 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  36.16 
 
 
412 aa  152  7e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  36.08 
 
 
277 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  37.59 
 
 
279 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  33.81 
 
 
397 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  35.14 
 
 
274 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 
278 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  36.64 
 
 
277 aa  150  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09051  putative dihydropteroate synthase  31.07 
 
 
280 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249023  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
278 aa  149  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  34.43 
 
 
280 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  37.04 
 
 
282 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 
282 aa  148  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 
282 aa  148  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  32.95 
 
 
397 aa  148  9e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
286 aa  148  9e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  36.06 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  36.06 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  36.06 
 
 
282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3796  dihydropteroate synthase  41.9 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  0.318259 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  37.02 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  36.8 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  35.32 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  35.11 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  36.33 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>