28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1269 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1269  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1863  exosome complex RNA-binding protein Csl4  54.5 
 
 		 191 aa  224  6e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0509  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.61 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1438  RNA binding protein  31.11 
 
 		 237 aa  89.7  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0005  exosome complex RNA-binding protein Csl4  29.12 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0521  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.16 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1636  putative RNA-binding protein  28.8 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1566  RNA-binding protein  26.86 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1587  hypothetical protein  28.41 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2051  hypothetical protein  27.49 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.55265 
 
 
-
 
NC_006686  CND01650  conserved hypothetical protein  24.6 
 
 		 191 aa  51.2  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.432469  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1800  hypothetical protein  28.18 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.304148  normal  0.352885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.32 
 
 		 774 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  45.95 
 
 		 661 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0817  hypothetical protein  37.31 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3722  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.82 
 
 		 701 aa  42  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.3 
 
 		 774 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1422  RNA-binding S1 domain-containing protein  27.59 
 
 		 503 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.324209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  32.89 
 
 		 772 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3028  RNA binding S1 domain protein  33.82 
 
 		 754 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1792  putative transcription accessory protein  30.23 
 
 		 793 aa  41.6  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781108  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  32.89 
 
 		 773 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  31.88 
 
 		 584 aa  41.6  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 861 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.29 
 
 		 774 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  32.89 
 
 		 774 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.29 
 
 		 774 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1862  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.38 
 
 		 827 aa  41.2  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>