11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0521 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0521  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 188 aa  376  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0509  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.15 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0005  exosome complex RNA-binding protein Csl4  32.04 
 
 		 185 aa  95.1  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1438  RNA binding protein  29.67 
 
 		 237 aa  86.7  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1636  putative RNA-binding protein  34.62 
 
 		 318 aa  85.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1863  exosome complex RNA-binding protein Csl4  33.7 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1587  hypothetical protein  31.64 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1800  hypothetical protein  30.56 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.304148  normal  0.352885 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1269  RNA binding S1 domain protein  30.16 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2051  hypothetical protein  32.61 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.55265 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0817  hypothetical protein  30.97 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>