12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1587 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1587  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  355  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2051  hypothetical protein  75.43 
 
 		 178 aa  271  3e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.55265 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1800  hypothetical protein  69.89 
 
 		 178 aa  260  8e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.304148  normal  0.352885 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0817  hypothetical protein  67.05 
 
 		 178 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0509  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.78 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1438  RNA binding protein  29.57 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0521  RNA-binding S1 domain-containing protein  31.64 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1269  RNA binding S1 domain protein  28.41 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0005  exosome complex RNA-binding protein Csl4  28.89 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1636  putative RNA-binding protein  28.09 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1863  exosome complex RNA-binding protein Csl4  40.68 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1566  RNA-binding protein  19.64 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>