14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0509 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0509  RNA-binding S1 domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0521  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.15 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1269  RNA binding S1 domain protein  29.61 
 
 		 189 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1863  exosome complex RNA-binding protein Csl4  32.58 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1800  hypothetical protein  35.36 
 
 		 178 aa  87.8  8e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.304148  normal  0.352885 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2051  hypothetical protein  32.79 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.55265 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0817  hypothetical protein  35.16 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1636  putative RNA-binding protein  28.49 
 
 		 318 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1587  hypothetical protein  32.22 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0005  exosome complex RNA-binding protein Csl4  25.14 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1438  RNA binding protein  24.73 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1566  RNA-binding protein  24.59 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8172  predicted protein  29.46 
 
 		 127 aa  42  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000199423  normal  0.0516105 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08301  conserved hypothetical protein  45.45 
 
 		 641 aa  40.8  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000000882961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>