11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1863 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1863  exosome complex RNA-binding protein Csl4  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1269  RNA binding S1 domain protein  54.5 
 
 		 189 aa  224  6e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1438  RNA binding protein  31.35 
 
 		 237 aa  101  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0005  exosome complex RNA-binding protein Csl4  32.97 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1636  putative RNA-binding protein  32.62 
 
 		 318 aa  89.4  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0509  RNA-binding S1 domain-containing protein  32.58 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0521  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.7 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2051  hypothetical protein  29.41 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.55265 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1587  hypothetical protein  40.68 
 
 		 177 aa  44.7  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01650  conserved hypothetical protein  25.81 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.432469  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1566  RNA-binding protein  18.29 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>