14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1636 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1636  putative RNA-binding protein  100 
 
 		 318 aa  644    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1438  RNA binding protein  46.96 
 
 		 237 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0005  exosome complex RNA-binding protein Csl4  45.9 
 
 		 185 aa  162  7e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1863  exosome complex RNA-binding protein Csl4  32.62 
 
 		 191 aa  89.4  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0521  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.62 
 
 		 188 aa  85.9  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0509  RNA-binding S1 domain-containing protein  28.49 
 
 		 186 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275397  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1269  RNA binding S1 domain protein  28.8 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37291  predicted protein  28.45 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8172  predicted protein  35.25 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000199423  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1566  RNA-binding protein  28.33 
 
 		 183 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1587  hypothetical protein  28.09 
 
 		 177 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1800  hypothetical protein  29.44 
 
 		 178 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.304148  normal  0.352885 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2051  hypothetical protein  27.81 
 
 		 178 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.55265 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00790  exosome complex exonuclease rrp4, putative  38.03 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.937014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>