15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1438 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1438  RNA binding protein  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1636  putative RNA-binding protein  46.96 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0005  exosome complex RNA-binding protein Csl4  41.4 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1863  exosome complex RNA-binding protein Csl4  31.35 
 
 		 191 aa  101  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1269  RNA binding S1 domain protein  31.11 
 
 		 189 aa  89.7  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0521  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.67 
 
 		 188 aa  86.7  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1587  hypothetical protein  28.8 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2051  hypothetical protein  26.2 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.55265 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1566  RNA-binding protein  29.44 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1800  hypothetical protein  27.72 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.304148  normal  0.352885 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0509  RNA-binding S1 domain-containing protein  24.73 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0817  hypothetical protein  25.7 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8172  predicted protein  28.69 
 
 		 127 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000199423  normal  0.0516105 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37291  predicted protein  25.94 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  33.72 
 
 		 140 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>