20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00790 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA00790  exosome complex exonuclease rrp4, putative  100 
 
 		 331 aa  674    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.937014  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31470  predicted protein  42.54 
 
 		 347 aa  235  6e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10406  exosome complex exonuclease Rrp4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05860)  40.24 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.674842  normal  0.0792702 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38656  predicted protein  42.86 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0934  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  25 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1936  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  25.77 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0837  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  25.93 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.628304  normal  0.123763 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0198  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  26.9 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000947081  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0582  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  28.64 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0183  K-like, type 1, subgroup  26.13 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000922938  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0431  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  28.87 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0115724 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1363  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  28.65 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0366  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  22.97 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2505  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  27.13 
 
 		 260 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00658393  normal  0.379662 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1793  K-like, type 1, subgroup  27.18 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.35215  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1382  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  21.58 
 
 		 238 aa  52.4  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0076  exosome complex RNA-binding protein Rrp4  25.77 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.141072  hitchhiker  0.00451109 
 
 
-
 
NC_006686  CND02660  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0005  exosome complex RNA-binding protein Csl4  39.44 
 
 		 185 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1636  putative RNA-binding protein  38.03 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>