91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0818 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0818  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 		 368 aa  765    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3765  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  79.08 
 
 		 368 aa  622  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0780  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  72.55 
 
 		 368 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.543738  hitchhiker  0.00363674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0536  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  71.43 
 
 		 372 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3985  hypothetical protein  71.54 
 
 		 371 aa  553  1e-156  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0736  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  69.02 
 
 		 368 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00212845  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0653  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  71.82 
 
 		 371 aa  548  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000831284  normal  0.0990196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0654  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  71.54 
 
 		 371 aa  547  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000361627  normal  0.261842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3368  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  71 
 
 		 371 aa  544  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136017  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3657  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.54 
 
 		 373 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0552864  hitchhiker  0.00000276812 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3839  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.27 
 
 		 373 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3716  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.54 
 
 		 373 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000520498  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0789  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.68 
 
 		 373 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00416162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0604  hypothetical protein  67.12 
 
 		 367 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4491  hypothetical protein  53.48 
 
 		 376 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01045  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.26 
 
 		 372 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0511  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  44.54 
 
 		 372 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3439  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.34 
 
 		 381 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3781  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.01 
 
 		 371 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.931404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1104  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.68 
 
 		 371 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.840143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.1 
 
 		 371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1144  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.12 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267483  normal  0.592452 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4139  hypothetical protein  30.88 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1207  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.87 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3877  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.52 
 
 		 372 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4308  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.97 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3568  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.15 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4623  hypothetical protein  31.9 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.67 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1091  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.1 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.108128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1829  hypothetical protein  28.75 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5954  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.43 
 
 		 371 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5248  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.48 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4289  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.72 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0209  putative arginine/ornithine transport operon(AotO) protein  29.1 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4766  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.54 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1522  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.39 
 
 		 376 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2190  hypothetical protein  29.43 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52760  hypothetical protein  31.19 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5309  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.87 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7092  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.09 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.53 
 
 		 371 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.53 
 
 		 371 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303573  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4844  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.53 
 
 		 371 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0256  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.81 
 
 		 371 aa  92.8  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2785  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.72 
 
 		 372 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  29.19 
 
 		 398 aa  90.5  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0227  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.33 
 
 		 371 aa  89.7  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4556  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.3 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00523769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4292  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.58 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0471  hypothetical protein  29.19 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1804  AotO  29.19 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0374  hypothetical protein  29.19 
 
 		 426 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210307  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3344  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.19 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0108468 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2106  hypothetical protein  29.19 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311297  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1499  hypothetical protein  29.19 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0297379  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0790  hypothetical protein  29.19 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4900  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.85 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2996  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.85 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.85 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1981  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.55 
 
 		 377 aa  86.3  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2065  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.76 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.64 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3510  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.45 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2882  hypothetical protein  29.48 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0890746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0286  hypothetical protein  26.81 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0300  hypothetical protein  26.81 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.96 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0089486  normal  0.468732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.71 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1362  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.6 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119521 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2033  hypothetical protein  21.91 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0562741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  36.49 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.56 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.7 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.57 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.33 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.59 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0288  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.8 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.47 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0516  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.08 
 
 		 327 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2911  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.31 
 
 		 337 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  20.68 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  20.89 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  33.77 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0759  hypothetical protein  22.08 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0635712  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.89 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.78 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  21.36 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4703  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.85 
 
 		 333 aa  43.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.261304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2778  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.16 
 
 		 346 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000135015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  30.59 
 
 		 334 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>