76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2401 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 
368 aa  747    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2882  hypothetical protein  46.13 
 
 
371 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0890746  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4308  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.26 
 
 
371 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782428  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1144  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.16 
 
 
371 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267483  normal  0.592452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1104  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.16 
 
 
371 aa  288  8e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.840143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1522  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.99 
 
 
376 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.73 
 
 
371 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3781  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.05 
 
 
371 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.931404  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1499  hypothetical protein  42.2 
 
 
371 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0297379  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1804  AotO  42.2 
 
 
426 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2106  hypothetical protein  42.2 
 
 
371 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311297  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0471  hypothetical protein  42.2 
 
 
426 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0374  hypothetical protein  42.2 
 
 
426 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210307  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0790  hypothetical protein  42.2 
 
 
371 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  42.02 
 
 
398 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3877  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.05 
 
 
372 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4139  hypothetical protein  44.02 
 
 
372 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4766  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.32 
 
 
371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5309  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.32 
 
 
371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385828  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3344  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.13 
 
 
371 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0108468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2190  hypothetical protein  39.25 
 
 
371 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5954  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.2 
 
 
371 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120716  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1207  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.23 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.05 
 
 
371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4844  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.05 
 
 
371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.05 
 
 
371 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303573  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.82 
 
 
371 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0227  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  39.52 
 
 
371 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5248  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.09 
 
 
371 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0209  putative arginine/ornithine transport operon(AotO) protein  40.27 
 
 
371 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1091  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.55 
 
 
370 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.108128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4623  hypothetical protein  42.12 
 
 
370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0256  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.05 
 
 
371 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52760  hypothetical protein  41.64 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7092  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40 
 
 
371 aa  252  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.51 
 
 
371 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2996  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.51 
 
 
371 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4900  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.51 
 
 
371 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2065  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.11 
 
 
370 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3568  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.48 
 
 
370 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1829  hypothetical protein  40.93 
 
 
370 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2785  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.81 
 
 
372 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4289  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.38 
 
 
374 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.67 
 
 
403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0089486  normal  0.468732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1981  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.05 
 
 
377 aa  206  7e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4556  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  36.99 
 
 
353 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00523769  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3510  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.08 
 
 
353 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4292  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.81 
 
 
352 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0300  hypothetical protein  31.61 
 
 
353 aa  143  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0286  hypothetical protein  31.61 
 
 
353 aa  143  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.71 
 
 
353 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0653  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.97 
 
 
371 aa  110  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000831284  normal  0.0990196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0654  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.43 
 
 
371 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000361627  normal  0.261842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3839  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.03 
 
 
373 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3368  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.55 
 
 
371 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136017  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3985  hypothetical protein  31.77 
 
 
371 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0789  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.61 
 
 
373 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00416162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3657  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.61 
 
 
373 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0552864  hitchhiker  0.00000276812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3716  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.61 
 
 
373 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000520498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3765  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.97 
 
 
368 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0604  hypothetical protein  32.29 
 
 
367 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0511  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.13 
 
 
372 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0536  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.5 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0780  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.22 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.543738  hitchhiker  0.00363674 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0736  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.3 
 
 
368 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00212845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0818  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.62 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3439  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.33 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4491  hypothetical protein  27.91 
 
 
376 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01045  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.42 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2075  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.62 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.763346  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0644  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.27 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0058  hypothetical protein  25.65 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.630853  hitchhiker  0.00778397 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  29.63 
 
 
879 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.33 
 
 
346 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  32.1 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.42 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>