118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0780 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0780  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 
368 aa  761    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.543738  hitchhiker  0.00363674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3765  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  72.01 
 
 
368 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139179 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0818  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  72.55 
 
 
368 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0654  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.73 
 
 
371 aa  554  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000361627  normal  0.261842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3368  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.73 
 
 
371 aa  554  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136017  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0536  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.03 
 
 
372 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0653  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.73 
 
 
371 aa  552  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000831284  normal  0.0990196 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0736  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  68.75 
 
 
368 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00212845  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3985  hypothetical protein  70.19 
 
 
371 aa  547  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3716  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.27 
 
 
373 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000520498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3839  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.27 
 
 
373 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0789  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70 
 
 
373 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00416162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3657  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  69.73 
 
 
373 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0552864  hitchhiker  0.00000276812 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0604  hypothetical protein  68.48 
 
 
367 aa  524  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4491  hypothetical protein  53.37 
 
 
376 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01045  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.18 
 
 
372 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0511  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.96 
 
 
372 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3439  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.23 
 
 
381 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.23 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3877  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.64 
 
 
372 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1104  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.85 
 
 
371 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.840143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4139  hypothetical protein  30.56 
 
 
372 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.48 
 
 
371 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1144  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.06 
 
 
371 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267483  normal  0.592452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1207  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.78 
 
 
372 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4308  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.53 
 
 
371 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782428  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4766  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.51 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3781  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.78 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.931404  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5248  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.28 
 
 
371 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2785  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.56 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5309  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.89 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385828  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1522  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.84 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0209  putative arginine/ornithine transport operon(AotO) protein  28.82 
 
 
371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2996  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.28 
 
 
371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.28 
 
 
371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4900  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.28 
 
 
371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0256  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.19 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7092  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.95 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  31.17 
 
 
398 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1091  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.74 
 
 
370 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.108128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4623  hypothetical protein  29.6 
 
 
370 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.86 
 
 
371 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.86 
 
 
371 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303573  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3344  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.4 
 
 
371 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0108468 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4844  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.86 
 
 
371 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5954  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.63 
 
 
371 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120716  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1499  hypothetical protein  30.31 
 
 
371 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0297379  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1804  AotO  30.31 
 
 
426 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0227  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.12 
 
 
371 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2106  hypothetical protein  30.31 
 
 
371 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311297  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0471  hypothetical protein  30.31 
 
 
426 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0374  hypothetical protein  30.31 
 
 
426 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210307  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0790  hypothetical protein  30.31 
 
 
371 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2190  hypothetical protein  29.47 
 
 
371 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3568  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.95 
 
 
370 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4289  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.93 
 
 
374 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1829  hypothetical protein  26.96 
 
 
370 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2882  hypothetical protein  30.47 
 
 
371 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0890746  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52760  hypothetical protein  28.66 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2065  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.44 
 
 
370 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1981  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.25 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4292  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.63 
 
 
352 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.74 
 
 
353 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4556  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.05 
 
 
353 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00523769  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.29 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0286  hypothetical protein  26.74 
 
 
353 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0300  hypothetical protein  26.74 
 
 
353 aa  90.1  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3510  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.79 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.65 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0089486  normal  0.468732 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.18 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.23 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  27.07 
 
 
371 aa  52  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.05 
 
 
337 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.6 
 
 
346 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0288  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.1 
 
 
333 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7499  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.55 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0759996  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  26.57 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02465  hypothetical protein  24.04 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0353746  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5243  ectoine utilization protein EutE  21.79 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.472707 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3134  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.18 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2100  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.59 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66463  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0298  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.92 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0428528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1675  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.5 
 
 
334 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.353223  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3178  hypothetical protein  22.09 
 
 
335 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.860392  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0840  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.29 
 
 
318 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.678426  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  21.45 
 
 
356 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  21.84 
 
 
346 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2911  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.48 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3692  ectoine utilization protein EutE  21.66 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.27 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.26 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0516  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  38.57 
 
 
327 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0742  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  28.77 
 
 
494 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.63 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0496  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.63 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004275  predicted deacylase  21.45 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4703  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.12 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.261304  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000633  succinate dehydrogenase subunit  21.38 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2412  hypothetical protein  28.77 
 
 
412 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2273  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  28.77 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>