77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1091 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1091  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 		 370 aa  742    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.108128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4623  hypothetical protein  66.49 
 
 		 370 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1829  hypothetical protein  65.41 
 
 		 370 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3568  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  64.86 
 
 		 370 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2065  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  62.97 
 
 		 370 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52760  hypothetical protein  67.03 
 
 		 370 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4289  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  63.9 
 
 		 374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  46.63 
 
 		 398 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3344  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.63 
 
 		 371 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0108468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2882  hypothetical protein  50 
 
 		 371 aa  301  9e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0890746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5309  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.55 
 
 		 371 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3877  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  44.89 
 
 		 372 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4308  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.7 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5954  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.7 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4766  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.01 
 
 		 371 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4139  hypothetical protein  45.16 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1144  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.92 
 
 		 371 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267483  normal  0.592452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3781  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  44.65 
 
 		 371 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.931404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0790  hypothetical protein  46.36 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0374  hypothetical protein  46.36 
 
 		 426 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210307  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.28 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303573  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2106  hypothetical protein  46.36 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311297  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0471  hypothetical protein  46.36 
 
 		 426 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2190  hypothetical protein  45.16 
 
 		 371 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.51 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.28 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4844  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  45.28 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1804  AotO  46.36 
 
 		 426 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1499  hypothetical protein  46.36 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0297379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1104  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.11 
 
 		 371 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.840143 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0227  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  44.74 
 
 		 371 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1207  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.99 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.78 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5248  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.2 
 
 		 371 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2785  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.82 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1522  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.67 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0209  putative arginine/ornithine transport operon(AotO) protein  40.43 
 
 		 371 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.55 
 
 		 368 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7092  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.51 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0256  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.86 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4900  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.32 
 
 		 371 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.32 
 
 		 371 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2996  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  40.32 
 
 		 371 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  37.91 
 
 		 403 aa  216  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0089486  normal  0.468732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1981  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  41.91 
 
 		 377 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4556  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.23 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00523769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3510  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.08 
 
 		 353 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4292  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.69 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.11 
 
 		 353 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0300  hypothetical protein  31.94 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0286  hypothetical protein  31.94 
 
 		 353 aa  122  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0780  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.74 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.543738  hitchhiker  0.00363674 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0818  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.1 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3765  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.82 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0653  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.03 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000831284  normal  0.0990196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0604  hypothetical protein  32.31 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3368  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.47 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136017  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0654  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.47 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000361627  normal  0.261842 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3985  hypothetical protein  29.47 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3839  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.71 
 
 		 373 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0789  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.04 
 
 		 373 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00416162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3657  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.04 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0552864  hitchhiker  0.00000276812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3716  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.04 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000520498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0736  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.76 
 
 		 368 aa  96.7  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00212845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0536  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.67 
 
 		 372 aa  90.9  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3439  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.08 
 
 		 381 aa  89.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0511  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.71 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4491  hypothetical protein  26.58 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01045  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.07 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3168  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.98 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.66 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0999  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.64 
 
 		 476 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0298  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.38 
 
 		 318 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0428528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3354  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  34.07 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0260  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.52 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2827  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  20.94 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0840  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.06 
 
 		 318 aa  43.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.678426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>