99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4491 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4491  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  788    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0736  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  54.28 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00212845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3765  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  55.98 
 
 		 368 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139179 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3985  hypothetical protein  53.35 
 
 		 371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0818  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  53.48 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0653  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  53.35 
 
 		 371 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000831284  normal  0.0990196 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3368  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  53.21 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136017  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0654  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  53.21 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000361627  normal  0.261842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0536  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  53.85 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0604  hypothetical protein  53.1 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3657  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.41 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0552864  hitchhiker  0.00000276812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0789  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.43 
 
 		 373 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00416162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0780  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  53.37 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.543738  hitchhiker  0.00363674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3839  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  52.14 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3716  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  51.87 
 
 		 373 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000520498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01045  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  47.59 
 
 		 372 aa  352  7e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0511  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  48.14 
 
 		 372 aa  348  7e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3439  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.73 
 
 		 381 aa  152  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1104  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.19 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.840143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1144  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.19 
 
 		 371 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267483  normal  0.592452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.25 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3781  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.01 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.931404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1522  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.09 
 
 		 376 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5954  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.17 
 
 		 371 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3877  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.08 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4139  hypothetical protein  30.03 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2190  hypothetical protein  29.22 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4308  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.93 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2785  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.3 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4766  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.81 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5309  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.49 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3344  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.05 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0108468 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.78 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.78 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303573  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4844  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.78 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4556  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.41 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00523769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1207  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.95 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.06 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1829  hypothetical protein  27.78 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4292  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.47 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0227  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.12 
 
 		 371 aa  99.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7092  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.25 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3568  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.91 
 
 		 370 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  28.71 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3510  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.06 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0209  putative arginine/ornithine transport operon(AotO) protein  26.71 
 
 		 371 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5248  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.54 
 
 		 371 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4900  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.07 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.07 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2996  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.07 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0790  hypothetical protein  29.08 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0374  hypothetical protein  29.08 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210307  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1804  AotO  29.08 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2106  hypothetical protein  29.08 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311297  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1499  hypothetical protein  29.08 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0297379  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0471  hypothetical protein  29.08 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4623  hypothetical protein  27.24 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.2 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0300  hypothetical protein  23.95 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0286  hypothetical protein  23.95 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0256  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.79 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1091  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.58 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.108128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4289  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.08 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2882  hypothetical protein  26.39 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0890746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2065  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.32 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52760  hypothetical protein  27.02 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1981  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.82 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.86 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.6 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0089486  normal  0.468732 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0516  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.45 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2911  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.17 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  34.78 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1255  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.62 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4703  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.3 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.261304  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2100  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.43 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66463  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0288  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.08 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7662  putative succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.79 
 
 		 348 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.64 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0298  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.05 
 
 		 318 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0428528 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.6 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1693  hypothetical protein  22.73 
 
 		 340 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603586  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0742  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  21.68 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1885  hypothetical protein  22.01 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1677  hypothetical protein  22.73 
 
 		 340 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  27.19 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2412  hypothetical protein  21.68 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2273  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  25.42 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0557  hypothetical protein  22.73 
 
 		 340 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.961363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0705  hypothetical protein  27.91 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7499  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.36 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0759996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4196  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  21.73 
 
 		 344 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4117  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.32 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.799138 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3692  ectoine utilization protein EutE  20 
 
 		 334 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3178  hypothetical protein  20.78 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.860392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.14 
 
 		 350 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2731  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.15 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.291294  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  19.94 
 
 		 338 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2148  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.87 
 
 		 343 aa  43.1  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  20.75 
 
 		 346 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>