78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0536 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0536  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  100 
 
 		 372 aa  778    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3985  hypothetical protein  76.65 
 
 		 371 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0654  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  76.37 
 
 		 371 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000361627  normal  0.261842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0789  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  73.84 
 
 		 373 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00416162  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3368  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  76.1 
 
 		 371 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136017  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3657  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  73.7 
 
 		 373 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0552864  hitchhiker  0.00000276812 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3716  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  73.97 
 
 		 373 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000520498  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0653  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  75.27 
 
 		 371 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000831284  normal  0.0990196 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3839  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  73.22 
 
 		 373 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0736  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.84 
 
 		 368 aa  569  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00212845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3765  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  71.12 
 
 		 368 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139179 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0818  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  71.43 
 
 		 368 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0780  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.03 
 
 		 368 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.543738  hitchhiker  0.00363674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0604  hypothetical protein  70.88 
 
 		 367 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4491  hypothetical protein  53.85 
 
 		 376 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01045  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  44.59 
 
 		 372 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0511  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  42.03 
 
 		 372 aa  316  4e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3439  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.54 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3781  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.46 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.931404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4139  hypothetical protein  28.81 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3877  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.81 
 
 		 372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1104  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.75 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.840143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.58 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1522  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.38 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1144  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.97 
 
 		 371 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267483  normal  0.592452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1207  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.81 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4308  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.48 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.88 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2785  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.45 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5954  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.57 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4766  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.71 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2190  hypothetical protein  28.26 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.39 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.39 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303573  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4844  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.39 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4623  hypothetical protein  27.9 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5309  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.39 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5248  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.56 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.49 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2882  hypothetical protein  28.03 
 
 		 371 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0890746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3568  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.95 
 
 		 370 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0300  hypothetical protein  24.79 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989663  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0286  hypothetical protein  24.79 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0227  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.75 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0209  putative arginine/ornithine transport operon(AotO) protein  26.62 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  28.85 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3510  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.65 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7092  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.95 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3344  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.94 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0108468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.5 
 
 		 368 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4900  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.3 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.3 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2996  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.3 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1829  hypothetical protein  27.33 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1091  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.67 
 
 		 370 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.108128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4556  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.72 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00523769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4292  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.52 
 
 		 352 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4289  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.24 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1981  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.94 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52760  hypothetical protein  28.62 
 
 		 370 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1499  hypothetical protein  29.17 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0297379  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0790  hypothetical protein  29.17 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2106  hypothetical protein  29.17 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311297  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0374  hypothetical protein  29.17 
 
 		 426 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210307  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0471  hypothetical protein  29.17 
 
 		 426 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1804  AotO  29.17 
 
 		 426 aa  86.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0256  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.28 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2065  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.48 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.47 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0089486  normal  0.468732 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.19 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  32.43 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.97 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00715  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  19.31 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0516  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.14 
 
 		 327 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.25 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2911  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.59 
 
 		 337 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  21.56 
 
 		 362 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.78 
 
 		 350 aa  43.9  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>