111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3985 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3985  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  770    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0654  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  93.53 
 
 		 371 aa  724    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000361627  normal  0.261842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3368  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  93.77 
 
 		 371 aa  722    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0136017  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0653  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  92.72 
 
 		 371 aa  718    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000831284  normal  0.0990196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0789  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  86.52 
 
 		 373 aa  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00416162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3716  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  87.6 
 
 		 373 aa  684    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000520498  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3839  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  86.25 
 
 		 373 aa  672    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3657  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  87.06 
 
 		 373 aa  682    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0552864  hitchhiker  0.00000276812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0536  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  76.65 
 
 		 372 aa  587  1e-166  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0736  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  73.5 
 
 		 368 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00212845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0604  hypothetical protein  73.76 
 
 		 367 aa  565  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3765  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  71.54 
 
 		 368 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139179 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0818  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  71.54 
 
 		 368 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157048 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0780  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  70.19 
 
 		 368 aa  547  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.543738  hitchhiker  0.00363674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4491  hypothetical protein  53.35 
 
 		 376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01045  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  46.28 
 
 		 372 aa  327  3e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0511  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  43.53 
 
 		 372 aa  317  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3439  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.91 
 
 		 381 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3781  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.95 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.931404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1522  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.87 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1104  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.89 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.840143 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.23 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4199  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.27 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5954  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.31 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1144  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.45 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267483  normal  0.592452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4308  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.94 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.782428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2190  hypothetical protein  30.12 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.684343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0209  putative arginine/ornithine transport operon(AotO) protein  29.17 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4139  hypothetical protein  31.09 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3877  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.62 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1207  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.27 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4766  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.34 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.63 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.63 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303573  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4844  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.63 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2882  hypothetical protein  29.36 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0890746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4623  hypothetical protein  29.81 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2133  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  30.12 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5309  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.03 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7092  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.12 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2996  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.3 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.3 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4900  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.3 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0227  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.23 
 
 		 371 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2401  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.41 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3344  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.57 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0108468 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1499  hypothetical protein  29.81 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0297379  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1804  AotO  29.81 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2106  hypothetical protein  29.81 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311297  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0471  hypothetical protein  29.81 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0374  hypothetical protein  29.81 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210307  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0790  hypothetical protein  29.81 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5248  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.84 
 
 		 371 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3568  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.23 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1091  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.47 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.108128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1829  hypothetical protein  28 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0256  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.99 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2785  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.33 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4289  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.96 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1981  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.7 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0370  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.58 
 
 		 353 aa  93.2  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4556  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.53 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00523769  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0286  hypothetical protein  26.3 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0300  hypothetical protein  26.3 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3510  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  24.93 
 
 		 353 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2065  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.5 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52760  hypothetical protein  28.18 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2437  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.46 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0089486  normal  0.468732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4292  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.56 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4154  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.43 
 
 		 346 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23200  predicted deacylase  34.67 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2911  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  25.89 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3886  succinylglutamatedesuccinylase/aspartoacylase  22.77 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3168  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.8 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3692  ectoine utilization protein EutE  22.15 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0161  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.6 
 
 		 426 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2062  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0516  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31 
 
 		 327 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1688  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  30.83 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4703  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.33 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.261304  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0742  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  27 
 
 		 494 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0725  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.71 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.330277  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4196  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.82 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.399198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1538  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  29.82 
 
 		 346 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  22.36 
 
 		 319 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0644  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.9 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3665  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  23.12 
 
 		 340 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2412  hypothetical protein  27 
 
 		 412 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6377  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  26.32 
 
 		 337 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0823471  normal  0.671945 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2273  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase family protein  28.72 
 
 		 403 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1693  hypothetical protein  28.72 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.603586  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2100  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.4 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66463  normal  0.437117 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1677  hypothetical protein  28.72 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1885  hypothetical protein  28.72 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0557  hypothetical protein  28.72 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.961363  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1872  hypothetical protein  25.35 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3941  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.07 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4425  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  28.07 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01154  hypothetical protein  33.93 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0496  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  35.96 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>