More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3143 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  100 
 
 
381 aa  753    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  51.34 
 
 
383 aa  328  7e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  47.58 
 
 
421 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  51.06 
 
 
384 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  46.29 
 
 
415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14610  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  44.92 
 
 
386 aa  275  9e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.427424  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  44.33 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  39.84 
 
 
391 aa  249  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  41.53 
 
 
384 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  36.5 
 
 
417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2509  aminotransferase class I and II  39.69 
 
 
385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  40.32 
 
 
386 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  33.6 
 
 
390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  39.2 
 
 
390 aa  212  9e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  31.99 
 
 
390 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  32.18 
 
 
514 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  38.24 
 
 
394 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  35.58 
 
 
386 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  31.94 
 
 
400 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  31.87 
 
 
391 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  30.53 
 
 
393 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  31.35 
 
 
397 aa  195  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  30.25 
 
 
393 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  30.25 
 
 
393 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  35.58 
 
 
385 aa  192  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  34.86 
 
 
392 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  29.44 
 
 
393 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  27.42 
 
 
383 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  38.17 
 
 
385 aa  190  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  32.63 
 
 
391 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  32.14 
 
 
372 aa  189  8e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  31.73 
 
 
386 aa  189  8e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  30.55 
 
 
390 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  31.98 
 
 
401 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  30.33 
 
 
383 aa  187  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  34.6 
 
 
385 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  26.61 
 
 
383 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  26.61 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  33.59 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  26.61 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  31.65 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  26.34 
 
 
383 aa  184  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  29.76 
 
 
386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  34.05 
 
 
385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  26.34 
 
 
383 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  26.34 
 
 
383 aa  182  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  26.61 
 
 
383 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  26.4 
 
 
383 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  34.97 
 
 
383 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  26.08 
 
 
383 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  27.02 
 
 
397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  30.98 
 
 
394 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  26.34 
 
 
383 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  34.66 
 
 
390 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  33.87 
 
 
387 aa  179  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  29.72 
 
 
389 aa  178  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  37.54 
 
 
399 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  32.7 
 
 
386 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 
397 aa  176  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  34.69 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  28.94 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  32.31 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  31.46 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  33.7 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  29.95 
 
 
395 aa  173  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  31.18 
 
 
392 aa  172  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  29.54 
 
 
387 aa  172  6.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  29.07 
 
 
404 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  32.23 
 
 
390 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  33.16 
 
 
394 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  32.1 
 
 
392 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  32.1 
 
 
392 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  31.69 
 
 
383 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  36.87 
 
 
386 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  29.41 
 
 
396 aa  169  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3079  aminotransferase class I and II  34.12 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171547  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  31.39 
 
 
393 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  29.17 
 
 
521 aa  166  9e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  35.23 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  32.78 
 
 
405 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  31.97 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  29.48 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  30.83 
 
 
392 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  32.49 
 
 
391 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  33.15 
 
 
385 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  38.29 
 
 
386 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  33.15 
 
 
385 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  26.95 
 
 
386 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  28.65 
 
 
393 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  30.64 
 
 
390 aa  159  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  31.34 
 
 
398 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  28.34 
 
 
393 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1614  cystathionine beta-lyase  30.05 
 
 
389 aa  155  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  27.47 
 
 
387 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  29.17 
 
 
390 aa  154  2e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  32.11 
 
 
396 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  26.82 
 
 
389 aa  153  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  28.13 
 
 
394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  23.85 
 
 
396 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  31.61 
 
 
400 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>